More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0697 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0697  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  100 
 
 
292 aa  603  1e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.8618e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3799  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  72.54 
 
 
299 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.13424e-06  hitchhiker  2.43395e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3900  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  69.23 
 
 
305 aa  418  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.43108e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0848  glutamate--tRNA ligase  68.73 
 
 
304 aa  414  1e-115  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.66391e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3491  glutamate--tRNA ligase  67.7 
 
 
304 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.45607e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0883  glutamate--tRNA ligase  68.04 
 
 
304 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  3.49981e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0871  Glutamate--tRNA ligase  67.7 
 
 
304 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.93825e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3129  glutamate--tRNA ligase  67.12 
 
 
299 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  9.21619e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3405  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  69.12 
 
 
299 aa  407  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.37292e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3130  glutamate--tRNA ligase  68.77 
 
 
319 aa  407  1e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.03356e-07  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0873  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  69.12 
 
 
299 aa  407  1e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3293  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  68.42 
 
 
299 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.89418e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0729  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  68.07 
 
 
299 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.94668e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3277  glutamate--tRNA ligase  68.53 
 
 
293 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  5.1469e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3171  glutamate--tRNA ligase  66.9 
 
 
287 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  8.37027e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0779  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  61.72 
 
 
290 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00289158  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002564  glutamyl-Q-tRNA synthetase  54.55 
 
 
287 aa  307  1e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.02231e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0126  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.24 
 
 
296 aa  306  4e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  3.6555e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0155  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.31 
 
 
308 aa  305  5e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.30797e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0147  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.31 
 
 
308 aa  304  9e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.35998e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3458  Glutamate--tRNA ligase  53.31 
 
 
308 aa  304  9e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.33336e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1031  Glutamate--tRNA ligase  53.26 
 
 
302 aa  304  9e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.011538  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00142  hypothetical protein  52.96 
 
 
308 aa  303  2e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  7.3692e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00143  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.96 
 
 
308 aa  303  2e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  9.65107e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3515  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.96 
 
 
308 aa  303  2e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000809743  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0148  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.96 
 
 
308 aa  303  3e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.29858e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3115  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.3 
 
 
352 aa  302  3e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000632224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3339  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.01 
 
 
321 aa  301  8e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.26145e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0153  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.61 
 
 
308 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.16792e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1163  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.3 
 
 
322 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.61 
 
 
308 aa  299  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  9.52983e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3986  glutamate--tRNA ligase  54.17 
 
 
303 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000239485  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3469  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.36 
 
 
394 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.16518e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4307  tRNA synthetase class I family protein  53.36 
 
 
315 aa  298  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1006  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.36 
 
 
384 aa  299  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.29322e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2820  Glutamate--tRNA ligase  54.2 
 
 
302 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00525716  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0684  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.09 
 
 
296 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000131697  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0202  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.46 
 
 
313 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0366994  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0201  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.56 
 
 
313 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000353889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0217  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.11 
 
 
313 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127053  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0219  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.11 
 
 
313 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  4.98005e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0213  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.21 
 
 
313 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0227861  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03546  putative glutamyl-tRNA synthetase-relatedprotein  45.98 
 
 
327 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00695044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0583  glutamate--tRNA ligase  49.65 
 
 
308 aa  266  3e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  49.64 
 
 
283 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62510  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.64 
 
 
293 aa  258  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.632499  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5440  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.99 
 
 
293 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03447  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.56 
 
 
266 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.76 
 
 
298 aa  252  5e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.64 
 
 
294 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3936  glutamate--tRNA ligase  45.26 
 
 
305 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.30965e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4805  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.83 
 
 
298 aa  239  3e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167775  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3373  glutamate--tRNA ligase  45.99 
 
 
298 aa  238  7e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0303473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00405  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.67 
 
 
299 aa  238  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3639  Glutamate--tRNA ligase  47.28 
 
 
318 aa  238  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0967  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  43.21 
 
 
295 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  49.79 
 
 
295 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.87127e-06 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0673  glutamate--tRNA ligase  46.02 
 
 
305 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.930403  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.74 
 
 
300 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.74 
 
 
300 aa  234  1e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.48174e-06 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.87 
 
 
295 aa  233  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0740  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.12 
 
 
295 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  6.57167e-09 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3061  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.92 
 
 
291 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.293014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.3 
 
 
301 aa  229  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  44.03 
 
 
303 aa  228  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.76322e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
301 aa  226  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0834  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.84 
 
 
295 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.82 
 
 
299 aa  225  5e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.29 
 
 
311 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.78146e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0676  glutamate--tRNA ligase  43.16 
 
 
310 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0518  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  40.14 
 
 
302 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.69 
 
 
296 aa  215  6e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  42.62 
 
 
314 aa  214  2e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.94 
 
 
310 aa  214  2e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  42.52 
 
 
311 aa  213  2e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.86478e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.38 
 
 
314 aa  213  3e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.42 
 
 
296 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.27 
 
 
310 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  44.14 
 
 
302 aa  208  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  41.5 
 
 
309 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5657  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.77 
 
 
297 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2749  Glutamate--tRNA ligase  42.32 
 
 
306 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242915  normal  0.441865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.86 
 
 
310 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4049  glutamate--tRNA ligase  44.61 
 
 
312 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963278  normal  0.0953958 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0851  Glutamate--tRNA ligase  39.47 
 
 
313 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.31695  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0922  glutamate--tRNA ligase  43.39 
 
 
300 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0900  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.45 
 
 
301 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.32 
 
 
294 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46 
 
 
298 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0982  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.69 
 
 
297 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46 
 
 
298 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46 
 
 
298 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46 
 
 
298 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2904  glutamate--tRNA ligase  40.58 
 
 
338 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.437681  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1982  glutamate--tRNA ligase  43.34 
 
 
323 aa  197  2e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1782  Glutamate--tRNA ligase  43.34 
 
 
323 aa  197  2e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.11 
 
 
314 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  41.81 
 
 
327 aa  196  4e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.6 
 
 
294 aa  196  4e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  44.24 
 
 
292 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>