53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0680 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0680  porin  100 
 
 		 388 aa  788    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.424836  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  64.02 
 
 		 403 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  60.45 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2557  porin  59.2 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1568  porin  55.26 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  hitchhiker  0.00000152354 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  56.65 
 
 		 403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000211873  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1654  porin  54.81 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000730706  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2723  porin Gram-negative type  55.06 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000866519  hitchhiker  0.00000818773 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1620  porin  54.57 
 
 		 403 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000207941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  54.95 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000337456  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  56.44 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000429036  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1631  porin  54.81 
 
 		 403 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000133613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3603  porin  54.46 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000908733  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2468  porin  55.67 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000293387  hitchhiker  0.000118178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1821  outer membrane porin, putative  55.67 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2536  porin  55.41 
 
 		 402 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000566311  unclonable  0.0000300208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2628  porin  55.7 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000106502  hitchhiker  0.00000892589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  50.26 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0276  porin  36.09 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3873  porin  36.09 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3669  porin  35.84 
 
 		 384 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4173  porin  34.85 
 
 		 384 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0312  outer membrane porin, putative  34.34 
 
 		 384 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4086  porin  34.6 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4055  porin  34.6 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3977  porin Gram-negative type  34.6 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2283  porin  34.26 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1487  porin  34.41 
 
 		 389 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3366  porin  34.41 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3681  porin  31.73 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3336  outer membrane porin, putative  34.6 
 
 		 384 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3060  outer membrane porin, putative  32.92 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  32.92 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0666  porin  27.2 
 
 		 324 aa  94  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  27.68 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  28.14 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06284  hypothetical protein  26.55 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  25.51 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  30.86 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000832  outer membrane protein C precursor  31.45 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0331596  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  23.59 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  22.25 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  23.65 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  23.49 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  23.49 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  23.49 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  20.75 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  20.75 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  20.75 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002599  outer membrane protein OmpU  24.04 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0233564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0971  putative outer membrane protein  24.68 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  34.18 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  22.55 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>