105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0626 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  53.43 
 
 		 897 aa  832    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  54.63 
 
 		 889 aa  823    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  53.95 
 
 		 887 aa  836    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  53.01 
 
 		 865 aa  820    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  54.39 
 
 		 887 aa  848    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  56.31 
 
 		 879 aa  905    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  52.98 
 
 		 850 aa  770    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  55.57 
 
 		 878 aa  877    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  56.44 
 
 		 889 aa  916    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  44.59 
 
 		 836 aa  658    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  53.15 
 
 		 849 aa  771    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  100 
 
 		 845 aa  1691    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  55.96 
 
 		 889 aa  902    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  55.09 
 
 		 840 aa  836    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  56.61 
 
 		 884 aa  909    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  44.59 
 
 		 836 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  41.94 
 
 		 872 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  31.29 
 
 		 817 aa  310  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  28.98 
 
 		 817 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.84 
 
 		 817 aa  267  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  29.6 
 
 		 836 aa  266  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  30.17 
 
 		 825 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.82 
 
 		 820 aa  230  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  28.76 
 
 		 819 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  30.87 
 
 		 819 aa  221  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  29.28 
 
 		 821 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  28.75 
 
 		 821 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  29 
 
 		 800 aa  212  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.67 
 
 		 820 aa  209  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  30.15 
 
 		 793 aa  205  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.43 
 
 		 849 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 		 847 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  28.34 
 
 		 821 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  26.16 
 
 		 813 aa  197  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  29.52 
 
 		 804 aa  195  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.27 
 
 		 850 aa  194  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.1 
 
 		 847 aa  194  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  27.52 
 
 		 803 aa  191  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  28.9 
 
 		 821 aa  190  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  32.08 
 
 		 802 aa  180  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  36.41 
 
 		 820 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.37 
 
 		 866 aa  177  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  29.22 
 
 		 795 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  35.03 
 
 		 819 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.55 
 
 		 855 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.29 
 
 		 870 aa  164  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  35.03 
 
 		 819 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  25.58 
 
 		 843 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  28.54 
 
 		 795 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  28.79 
 
 		 795 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.8 
 
 		 845 aa  134  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  33.05 
 
 		 800 aa  132  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  32.94 
 
 		 826 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.61 
 
 		 858 aa  129  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 		 839 aa  124  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  26.35 
 
 		 929 aa  120  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  22.99 
 
 		 857 aa  117  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  29.01 
 
 		 815 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  28.21 
 
 		 843 aa  107  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.05 
 
 		 851 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.45 
 
 		 858 aa  107  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  23.7 
 
 		 867 aa  104  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 		 846 aa  104  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  26.18 
 
 		 842 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  26.65 
 
 		 841 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 842 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 842 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 		 884 aa  88.6  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  26 
 
 		 753 aa  88.2  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  23.06 
 
 		 844 aa  83.2  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  22.86 
 
 		 857 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  21.27 
 
 		 850 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  27.37 
 
 		 837 aa  74.7  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  22.11 
 
 		 855 aa  72.8  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  22.83 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  23.31 
 
 		 846 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  21.37 
 
 		 855 aa  70.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  23.51 
 
 		 868 aa  64.7  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  20.93 
 
 		 852 aa  64.3  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  21.3 
 
 		 855 aa  60.1  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 877 aa  58.5  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  25.38 
 
 		 877 aa  57.8  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  21.03 
 
 		 842 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  20.72 
 
 		 371 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.26 
 
 		 841 aa  51.6  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 414 aa  51.2  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.55 
 
 		 829 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  19.55 
 
 		 829 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  22.74 
 
 		 866 aa  50.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  22.15 
 
 		 853 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  26.62 
 
 		 404 aa  48.5  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 835 aa  48.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 		 835 aa  48.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  20.83 
 
 		 849 aa  47.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  20.17 
 
 		 849 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  20.55 
 
 		 407 aa  47  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 805 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  20.73 
 
 		 397 aa  45.8  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  21.5 
 
 		 846 aa  45.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  20.83 
 
 		 833 aa  45.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>