26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0603 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0603  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  798    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4131  hypothetical protein  72.3 
 
 
388 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0130576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3221  hypothetical protein  73.56 
 
 
386 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0332861  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3969  hypothetical protein  67.99 
 
 
390 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0546  hypothetical protein  67.77 
 
 
394 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0578  hypothetical protein  66.58 
 
 
385 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.056117  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0835  hypothetical protein  66.67 
 
 
385 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0844  hypothetical protein  67.5 
 
 
389 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3329  hypothetical protein  66.67 
 
 
385 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0837  hypothetical protein  66.67 
 
 
389 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.240462  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0693  hypothetical protein  66.67 
 
 
385 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226756  normal  0.897132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3441  hypothetical protein  66.11 
 
 
385 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00415893  normal  0.25947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3158  hypothetical protein  66.94 
 
 
384 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0013201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0812  hypothetical protein  66.39 
 
 
389 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000162038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3523  hypothetical protein  66.67 
 
 
384 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0015438  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2971  hypothetical protein  57.44 
 
 
399 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0733  hypothetical protein  45.97 
 
 
391 aa  329  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4467  secreted protein  35.7 
 
 
423 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207667  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1934  hypothetical protein  35.19 
 
 
364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2682  hypothetical protein  28.85 
 
 
453 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2117  secreted protein  32.12 
 
 
415 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2869  hypothetical protein  26.78 
 
 
537 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00620  hypothetical protein  27.78 
 
 
553 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486509  normal  0.628936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0052  hypothetical protein  28.21 
 
 
553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6996  hypothetical protein  33.6 
 
 
500 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17670  hypothetical protein  37.84 
 
 
279 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.276623  normal  0.654681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>