82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0485 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  100 
 
 
162 aa  339  8e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  83.33 
 
 
162 aa  257  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  76.51 
 
 
166 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  67.9 
 
 
162 aa  239  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  65.43 
 
 
162 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  67.9 
 
 
162 aa  230  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  65.43 
 
 
163 aa  214  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  65.43 
 
 
163 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  62.35 
 
 
163 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  62.96 
 
 
163 aa  204  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  64.81 
 
 
163 aa  201  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  64.81 
 
 
163 aa  200  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  53.09 
 
 
162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  46.53 
 
 
173 aa  153  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  43.71 
 
 
165 aa  143  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  45.28 
 
 
167 aa  134  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  41.22 
 
 
180 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  39.24 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  42.18 
 
 
178 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  41.5 
 
 
178 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  39.74 
 
 
182 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  39.74 
 
 
182 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  40.37 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  37.11 
 
 
173 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  39.04 
 
 
181 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  36.24 
 
 
191 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  40.65 
 
 
171 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  34.36 
 
 
193 aa  100  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  38 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  38 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  39.32 
 
 
176 aa  97.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  35.46 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  37.59 
 
 
181 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  37.01 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  37.01 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  37.01 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  37.01 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  29.94 
 
 
193 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  31.37 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  31.82 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  30.12 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  34.31 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  29.52 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  31.21 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  30.25 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  35.16 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  33.09 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  27.61 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  30.3 
 
 
189 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  37.6 
 
 
176 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  26.03 
 
 
201 aa  60.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  25.17 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  28.48 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  28.48 
 
 
167 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  28.48 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  31.88 
 
 
181 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  28.48 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  27.81 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  27.81 
 
 
167 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  28.48 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  28.48 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  28.48 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  26.85 
 
 
204 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  25.36 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  27.45 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  26.97 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0347  NosL protein  25 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.252116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  26.85 
 
 
204 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  23.38 
 
 
172 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  28.68 
 
 
364 aa  47.8  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  25.71 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  27.11 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  27.15 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  27.98 
 
 
364 aa  44.7  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  26.83 
 
 
131 aa  45.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  26.28 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  23.49 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  25.35 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  26.67 
 
 
918 aa  43.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  24.65 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0445  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  21.57 
 
 
155 aa  41.2  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.29239e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  27.59 
 
 
222 aa  41.2  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>