225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0475 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3405  Na+/H+ antiporter NhaC  77.78 
 
 
491 aa  762    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.190303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0475  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
509 aa  1024    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0490  Na+/H+ antiporter NhaC  73.79 
 
 
499 aa  764    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0475  Na+/H+ antiporter NhaC  78.39 
 
 
505 aa  798    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2457  Na+/H+ antiporter NhaC  68.79 
 
 
494 aa  704    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4486  Na+/H+ antiporter NhaC  75.74 
 
 
514 aa  789    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0344  Na+/H+ antiporter NhaC  75.8 
 
 
506 aa  764    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  56.12 
 
 
491 aa  554  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1995  Na+/H+ antiporter NhaC  55.24 
 
 
506 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00594855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2809  Na+/H+ antiporter NhaC  50.94 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0607804  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3531  Na+/H+ antiporter NhaC  55.06 
 
 
477 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0661235 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12548  Na+/H+ antiporter  43.12 
 
 
501 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.678652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0310  Na+/H+ antiporter  42.12 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.186537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0313  Na+/H+ antiporter  42.12 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000868354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0435  Na+/H+ antiporter NhaC  41.7 
 
 
473 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0435  Na+/H+ antiporter NhaC  41.7 
 
 
473 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0321  Na+/H+ antiporter NhaC  42.57 
 
 
473 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  42.16 
 
 
473 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0326  Na+/H+ antiporter NhaC  41.29 
 
 
473 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000241995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0341  Na+/H+ antiporter NhaC  41.29 
 
 
473 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0372  Na+/H+ antiporter NhaC  41.29 
 
 
473 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4931  Na+/H+ antiporter NhaC  41.94 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.312276  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2723  Na+/H+ antiporter NhaC  42.31 
 
 
472 aa  362  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1400  Na+/H+ antiporter NhaC  39.42 
 
 
509 aa  340  4e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.226086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  38.12 
 
 
502 aa  334  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  37.02 
 
 
494 aa  332  8e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  40.76 
 
 
457 aa  322  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0548  Na+/H+ antiporter NhaC  38.43 
 
 
510 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0362545  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  36.31 
 
 
484 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0177  Na+/H+ antiporter NhaC  38.15 
 
 
471 aa  311  2e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286543  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  37.34 
 
 
496 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03793  Na+/H+ antiporter, NhaC family protein  36.73 
 
 
495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0896  Na+/H+ antiporter NhaC  37.04 
 
 
489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0184  Na+/H+ antiporter NhaC  37.25 
 
 
470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0528403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  39.72 
 
 
457 aa  306  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0793  Na(+)/H(+) antiporter  37.88 
 
 
469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3226  Na+/H+ antiporter NhaC  37.08 
 
 
465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  38.9 
 
 
461 aa  302  9e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  39.95 
 
 
457 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  39.95 
 
 
457 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0133  NahC family Na(+)/H(+) antiporter  37.34 
 
 
496 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  35.77 
 
 
482 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  35.67 
 
 
474 aa  293  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3863  Na+/H+ antiporter  40.82 
 
 
457 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3877  Na+/H+ antiporter  40.58 
 
 
457 aa  292  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.335407  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  36.64 
 
 
458 aa  292  8e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4030  Na+/H+ antiporter NhaC  40.82 
 
 
457 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.623571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4345  Na+/H+ antiporter NhaC  40.82 
 
 
457 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4146  Na+/H+ antiporter NhaC  40.82 
 
 
457 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4256  Na+/H+ antiporter NhaC  40.82 
 
 
457 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4193  Na+/H+ antiporter NhaC  40.58 
 
 
457 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2832  Na+/H+ antiporter NhaC  39.21 
 
 
496 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1725  Na+/H+ antiporter NhaC  37.72 
 
 
482 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2609  Na+/H+ antiporter NhaC  35.7 
 
 
478 aa  290  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3649  Na+/H+ antiporter NhaC  35.8 
 
 
488 aa  289  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12540  Na+ antiporter NhaC  36.29 
 
 
475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.859822 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0736  Na+/H+ antiporter NhaC  32.99 
 
 
467 aa  283  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000132088  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1609  sodium/proton antiporter  37.56 
 
 
484 aa  281  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4039  Na+/H+ antiporter NhaC  37.37 
 
 
491 aa  279  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  34.73 
 
 
502 aa  277  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1400  Na+/H+ antiporter NhaC  35.53 
 
 
510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000509696  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1609  Na+/H+ antiporter NhaC  34.47 
 
 
483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002927  Na+/H+ antiporter NhaC  33.41 
 
 
477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0434616  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1668  Na+/H+ antiporter NhaC  34.47 
 
 
483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03022  Na+/H+ antiporter  32.81 
 
 
478 aa  270  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2552  Na+/H+ antiporter NhaC  35.78 
 
 
463 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1670  Na+/H+ antiporter NhaC  34.27 
 
 
483 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1733  Na+/H+ antiporter NhaC  34.27 
 
 
483 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1787  Na+/H+ antiporter NhaC  34.27 
 
 
483 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  35.33 
 
 
463 aa  266  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  33.95 
 
 
467 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  33.04 
 
 
467 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  33.95 
 
 
467 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  34.74 
 
 
482 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2296  Na+/H+ antiporter NhaC  35.88 
 
 
487 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  33.95 
 
 
467 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2006  Na+/H+ antiporter  33.41 
 
 
451 aa  264  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.16502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1622  Na+/H+ antiporter  32.15 
 
 
481 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000132012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  32.96 
 
 
467 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  32.96 
 
 
467 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  33.26 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  33.26 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0461  Na+/H+ antiporter NhaC  35.09 
 
 
483 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  33.26 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  33.26 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  33.26 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3617  Na+/H+ antiporter NhaC  34.3 
 
 
479 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  33.41 
 
 
474 aa  256  6e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1967  Na+/H+ antiporter NhaC  35.43 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1856  Na+/H+ antiporter NhaC  35.43 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2651  Na+/H+ antiporter NhaC  31.48 
 
 
464 aa  256  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2709  Na+/H+ antiporter NhaC  32.71 
 
 
480 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0273  Na+/H+ antiporter NhaC  34.79 
 
 
475 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00082  Na+/H+ antiporter NhaC  37.72 
 
 
465 aa  245  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  32.86 
 
 
470 aa  243  7e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4869  Na+/H+ antiporter IbeT  32.22 
 
 
467 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1881  Na+/H+ antiporter NhaC  33.26 
 
 
465 aa  237  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2324  Na+/H+ antiporter NhaC  33.03 
 
 
466 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2367  Na+/H+ antiporter NhaC  32.81 
 
 
466 aa  230  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0166  Na+/H+ antiporter NhaC  31.27 
 
 
472 aa  227  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>