48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0324 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  100 
 
 
122 aa  254  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  80.33 
 
 
122 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  86.89 
 
 
122 aa  209  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  88.35 
 
 
123 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  87.38 
 
 
123 aa  197  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  80.33 
 
 
122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  37.4 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  33.04 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  31.36 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  33.33 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  29.66 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  30.7 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  30.25 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  30 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  30.25 
 
 
117 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  33.07 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  31.52 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  29.27 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  32.54 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  31.18 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  31.25 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.54 
 
 
593 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  29.37 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  30.88 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  34.52 
 
 
597 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  30.77 
 
 
135 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  34.52 
 
 
596 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  34.52 
 
 
596 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  34.52 
 
 
596 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.33 
 
 
596 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  27.07 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  34.52 
 
 
596 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  34.52 
 
 
596 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  34.52 
 
 
596 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  34.52 
 
 
596 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  32.56 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  32.94 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  35.06 
 
 
153 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  37.86 
 
 
589 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  28.79 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  28.57 
 
 
113 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  28 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  30.95 
 
 
126 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  29.51 
 
 
596 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  30.95 
 
 
596 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  28.95 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  36.25 
 
 
589 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  30.38 
 
 
596 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>