245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0314 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 493 aa  970    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  67.37 
 
 		 497 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  64.65 
 
 		 507 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  66.88 
 
 		 497 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  66.67 
 
 		 497 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  66.88 
 
 		 497 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  66.94 
 
 		 497 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  64.96 
 
 		 501 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  64.53 
 
 		 501 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  65.49 
 
 		 501 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  62.9 
 
 		 509 aa  569  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  53.47 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  36.35 
 
 		 533 aa  310  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  36.17 
 
 		 533 aa  310  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  37.5 
 
 		 518 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  36.86 
 
 		 526 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  35.58 
 
 		 524 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  36.25 
 
 		 521 aa  299  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  35.9 
 
 		 524 aa  298  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  35.31 
 
 		 533 aa  297  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  33.59 
 
 		 528 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  35.24 
 
 		 522 aa  295  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  35.24 
 
 		 522 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  35.64 
 
 		 522 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  36.76 
 
 		 521 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  34.83 
 
 		 522 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  36.44 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  36.65 
 
 		 527 aa  280  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  37.61 
 
 		 526 aa  279  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  33.88 
 
 		 521 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  33.61 
 
 		 515 aa  267  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  35.91 
 
 		 529 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  35.57 
 
 		 522 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  35.57 
 
 		 522 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  35.57 
 
 		 522 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  35.03 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  32.14 
 
 		 520 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  30.99 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  30.94 
 
 		 510 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  30.58 
 
 		 525 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  30.38 
 
 		 533 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  32.26 
 
 		 546 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  27.56 
 
 		 574 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  29.89 
 
 		 513 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  32.49 
 
 		 517 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  26.3 
 
 		 567 aa  177  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.1 
 
 		 550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  29.23 
 
 		 507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  28.89 
 
 		 515 aa  172  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  28.82 
 
 		 534 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  29.7 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  29.38 
 
 		 525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  29.3 
 
 		 504 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  28.21 
 
 		 521 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  27.06 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  28.3 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  28.28 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  25.5 
 
 		 569 aa  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25 
 
 		 567 aa  152  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  25.59 
 
 		 587 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  24.07 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  26.38 
 
 		 571 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  26.04 
 
 		 493 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.83 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.88 
 
 		 571 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  27.77 
 
 		 541 aa  143  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  27.36 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  24.06 
 
 		 577 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.24 
 
 		 564 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  24.06 
 
 		 577 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  25.47 
 
 		 466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  28.63 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  27.25 
 
 		 629 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  32.68 
 
 		 451 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  23.56 
 
 		 570 aa  138  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.97 
 
 		 594 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  27.22 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  23.87 
 
 		 577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  27.4 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  28.03 
 
 		 574 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  27.62 
 
 		 459 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  26.37 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  26.37 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  26.37 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  26.37 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  26.37 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.54 
 
 		 560 aa  127  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  26.19 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  23.32 
 
 		 470 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.79 
 
 		 638 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  25.77 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  25.4 
 
 		 460 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  42.22 
 
 		 201 aa  110  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  25 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  23.38 
 
 		 779 aa  107  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2256  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  23.03 
 
 		 512 aa  106  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04813  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  29.33 
 
 		 552 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  21.16 
 
 		 501 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12550  Na+/H+ antiporter  26.12 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.507606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17460  Na+/H+ antiporter  22.43 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.701721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>