More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0196 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
179 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.88699e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  96.65 
 
 
179 aa  356  1e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.91972e-07  unclonable  1.25829e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  95.53 
 
 
179 aa  353  6e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.16279e-08  unclonable  5.74011e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  93.85 
 
 
179 aa  345  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.06117e-06  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  93.3 
 
 
179 aa  343  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.84321e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  92.18 
 
 
179 aa  343  9e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  3.87746e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  92.74 
 
 
179 aa  342  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  91.62 
 
 
179 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.08905e-07  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  91.62 
 
 
179 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.53128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  91.62 
 
 
179 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.74213e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  91.62 
 
 
179 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.87667e-07  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  92.18 
 
 
179 aa  341  3e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.50399e-07  hitchhiker  1.69962e-09 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  92.18 
 
 
179 aa  340  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.26613e-05  unclonable  1.44866e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  92.18 
 
 
179 aa  340  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.74066e-07  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  91.62 
 
 
179 aa  339  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.28056e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  90.5 
 
 
179 aa  337  6e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.3393e-09  unclonable  8.47343e-06 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  82.68 
 
 
179 aa  311  2e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  79.89 
 
 
179 aa  308  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  1.47954e-05  hitchhiker  1.1465e-07 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  81.01 
 
 
181 aa  307  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  82.12 
 
 
179 aa  305  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  75.98 
 
 
179 aa  301  4e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  75.98 
 
 
179 aa  301  4e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  76.54 
 
 
179 aa  300  5e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.73991e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  75.98 
 
 
179 aa  301  5e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  5.68765e-09  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 
179 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.60301e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  76.54 
 
 
179 aa  299  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 
179 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 
179 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 
179 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 
179 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 
179 aa  298  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.53515e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 
179 aa  298  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  3.06823e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 
179 aa  295  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.13261e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3989  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 
179 aa  288  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0243679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3810  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 
179 aa  288  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.50853e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03110  hypothetical protein  75.42 
 
 
179 aa  285  3e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  2.80639e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4631  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 
179 aa  285  3e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.45599e-05  normal  0.589642 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03159  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 
179 aa  285  3e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  4.11475e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3693  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 
179 aa  285  3e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.2658e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3791  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 
179 aa  285  3e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.22149e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3502  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 
179 aa  285  3e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.25147e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0405  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 
179 aa  285  3e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.76742e-06  hitchhiker  1.51548e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3603  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 
179 aa  285  3e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.37541e-06  normal  0.028029 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0405  ribosomal protein L5  75.42 
 
 
179 aa  285  3e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.30558e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4532  50S ribosomal protein L5  74.86 
 
 
179 aa  284  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.49559e-08  hitchhiker  0.000603292 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3902  50S ribosomal protein L5  74.86 
 
 
179 aa  283  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.39799e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0295  50S ribosomal protein L5  74.86 
 
 
179 aa  283  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.20045e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0595  50S ribosomal protein L5  74.86 
 
 
179 aa  283  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.65071e-09  normal  0.330939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  72.07 
 
 
179 aa  281  5e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  1.40666e-07  unclonable  3.31495e-12 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  73.03 
 
 
179 aa  277  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.51494e-08  hitchhiker  2.15768e-06 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  71.35 
 
 
179 aa  276  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  71.91 
 
 
182 aa  275  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.65195e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  71.91 
 
 
182 aa  275  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  67.42 
 
 
179 aa  274  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  70.22 
 
 
179 aa  273  8e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  9.18773e-05  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  71.35 
 
 
179 aa  273  1e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  1.59394e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0339  50S ribosomal protein L5  72.32 
 
 
180 aa  272  2e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0509  50S ribosomal protein L5  72.32 
 
 
180 aa  272  2e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0543565  hitchhiker  3.88642e-10 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  72.07 
 
 
179 aa  272  2e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  70.22 
 
 
179 aa  271  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0331  50S ribosomal protein L5  71.91 
 
 
179 aa  269  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.86209e-22  unclonable  5.14338e-08 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 
179 aa  269  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0487  50S ribosomal protein L5  68.54 
 
 
179 aa  267  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  7.28696e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  69.66 
 
 
179 aa  266  8e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  8.23313e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  69.66 
 
 
183 aa  265  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  69.66 
 
 
183 aa  265  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0340  50S ribosomal protein L5  65.92 
 
 
181 aa  264  4e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  67.23 
 
 
180 aa  264  6e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  3.12511e-06  hitchhiker  9.22003e-07 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3285  50S ribosomal protein L5  67.23 
 
 
180 aa  264  6e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  5.00711e-07  hitchhiker  2.37864e-06 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  69.66 
 
 
178 aa  263  7e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  6.50709e-06  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0332  50S ribosomal protein L5  67.42 
 
 
179 aa  263  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  4.92925e-07  hitchhiker  0.000510256 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2312  50S ribosomal protein L5  70.22 
 
 
181 aa  263  8e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.16558e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  263  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  3.34346e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3937  50S ribosomal protein L5  69.1 
 
 
183 aa  263  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  69.1 
 
 
178 aa  263  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  1.02637e-06  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  65.92 
 
 
179 aa  262  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  67.8 
 
 
180 aa  262  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  6.1863e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  68.36 
 
 
180 aa  261  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  4.19375e-05  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  67.23 
 
 
180 aa  261  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  261  5e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4231  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  260  7e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  260  7e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  67.23 
 
 
184 aa  260  9e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  259  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.91784e-05  decreased coverage  1.59528e-12 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  259  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  259  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  5.62403e-14  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  259  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  65.92 
 
 
179 aa  259  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  67.42 
 
 
178 aa  259  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.21232e-10  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  67.42 
 
 
179 aa  258  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  2.58896e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 
179 aa  258  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.01329e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  5.41719e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 
180 aa  258  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  258  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.29438e-07  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 
179 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 
179 aa  258  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>