More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0194 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0168  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  246  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.80121e-09  hitchhiker  0.000304102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0194  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  246  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.68914e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0180  50S ribosomal protein L14  97.54 
 
 
122 aa  242  1e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.57275e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4680  50S ribosomal protein L14  96.72 
 
 
122 aa  239  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.05676e-08  unclonable  1.17044e-08 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0223  50S ribosomal protein L14  95.9 
 
 
122 aa  238  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.01155e-09  unclonable  7.31174e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4307  50S ribosomal protein L14  95.9 
 
 
122 aa  237  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.41408e-08  unclonable  4.97407e-11 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0158  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  237  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.51869e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0209  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  236  6e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.83704e-08  hitchhiker  1.3297e-09 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0209  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  236  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.78183e-08  unclonable  1.39083e-11 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3749  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  236  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.23635e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0241  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  236  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0204  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  236  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.38487e-07  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4046  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.76442e-07  unclonable  3.58198e-12 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0206  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.5278e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0210  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.95848e-09  unclonable  8.19027e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4160  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.82968e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3514  ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  214  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  9.71398e-07  hitchhiker  9.93182e-08 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  213  9e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  6.86211e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  83.61 
 
 
122 aa  211  2e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0494  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  211  3e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  5.12994e-07  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0499  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  211  3e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  1.01997e-08  decreased coverage  0.00104649 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0436  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  211  4e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  4.33356e-11  hitchhiker  9.95227e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0611  ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  210  6e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2159  ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  209  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  0.234702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  209  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  1.1877e-07  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  208  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  9.64027e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0333  ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  207  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.13124e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  207  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  4.45572e-08 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  205  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.98489e-08  unclonable  3.02699e-12 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  204  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.61836e-05  hitchhiker  1.00945e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  204  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2314  ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  202  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  2.8271e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  201  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  1.72755e-14  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  2.7231e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  3.05715e-05  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  3.79152e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3939  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 
122 aa  201  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001732  LSU ribosomal protein L14p (L23e)  83.74 
 
 
123 aa  200  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.62129e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00740  50S ribosomal protein L14  83.74 
 
 
123 aa  200  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0848  ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  200  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  200  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3432  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 
122 aa  200  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0231126  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  200  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  1.58675e-06  hitchhiker  3.86502e-06 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  200  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  1.57529e-09  decreased coverage  5.79661e-07 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0330  50S ribosomal protein L14  82.11 
 
 
123 aa  200  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  2.13819e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  200  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03112  hypothetical protein  81.3 
 
 
123 aa  200  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  2.01498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0403  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  200  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  1.32736e-07  hitchhiker  7.17726e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  200  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.02045e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  200  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.64384e-09  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3504  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  200  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.79404e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3695  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  200  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.88942e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4633  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  200  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  6.83604e-07  normal  0.378647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03161  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  200  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.2346e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0403  ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  200  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.77059e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 
122 aa  200  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  200  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0333  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
123 aa  199  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  9.2381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  199  1e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0415  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
123 aa  199  1e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0110237  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  199  1e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4534  50S ribosomal protein L14  82.11 
 
 
123 aa  199  1e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.43523e-09  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  199  1e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  2.90326e-10 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0999  ribosomal protein L14  83.61 
 
 
121 aa  199  1e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00274918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  199  1e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.11281e-09  hitchhiker  1.95891e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3904  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  198  2e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.92566e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0060  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  198  2e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  1.71332e-14  hitchhiker  1.54022e-17 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0293  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  198  2e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.13985e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0593  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  198  2e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.94944e-09  normal  0.41091 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0063  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  198  2e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  8.10078e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3741  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
123 aa  198  2e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  4.0815e-09  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0777  ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  198  2e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.94728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3812  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
123 aa  198  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  3.9471e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2164  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
123 aa  197  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.08066e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3991  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
123 aa  198  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000125728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  198  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3797  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
123 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1032  ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  197  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389871  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3699  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
123 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000119434  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3734  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
123 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000182354  normal  0.0166061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3626  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
123 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.11381e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3626  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
123 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00182904  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  197  4e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  7.75128e-05  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  197  4e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  1.57249e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  197  4e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  8.52888e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  197  4e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  9.89644e-10  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  2.438e-07  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  6.32835e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0431  50S ribosomal protein L14P  82.11 
 
 
123 aa  197  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0205903  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0070  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
123 aa  196  8e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.46326e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0504  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  195  1e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0466171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  3.3095e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.83624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0443  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  196  1e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00471045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  195  1e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  196  1e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  2.65489e-05  decreased coverage  1.45163e-12 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>