26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0097 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  311  3e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  56.77 
 
 
155 aa  187  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0091  hypothetical protein  59.12 
 
 
159 aa  171  2e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156914  hitchhiker  0.000348756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  51.61 
 
 
155 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  50.31 
 
 
155 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  51.61 
 
 
155 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  50.32 
 
 
155 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  50.32 
 
 
155 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  50.32 
 
 
155 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3912  hypothetical protein  49.68 
 
 
155 aa  150  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0048  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4350  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.488502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4492  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4295  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.617343  unclonable  3.76809e-12 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3719  hypothetical protein  64.95 
 
 
155 aa  133  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144984  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3625  hypothetical protein  51.18 
 
 
155 aa  130  8e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.638211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001912  hypothetical protein  34.9 
 
 
162 aa  82  3e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  37.59 
 
 
155 aa  75.1  4e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0232  hypothetical protein  32.14 
 
 
163 aa  72.4  2e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  33.08 
 
 
147 aa  70.1  1e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2403  hypothetical protein  34.23 
 
 
163 aa  67.8  5e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00580  hypothetical protein  32.82 
 
 
162 aa  67.8  5e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4824  hypothetical protein  35.2 
 
 
162 aa  66.2  1e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  30.07 
 
 
149 aa  66.2  2e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0208  hypothetical protein  30.61 
 
 
159 aa  62.8  2e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294068  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  29.55 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>