226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0090 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 
89 aa  172  2e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3985  export protein FliQ  76.4 
 
 
89 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3482  flagellar biosynthetic protein FliQ  74.16 
 
 
89 aa  139  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  70.79 
 
 
89 aa  136  9e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0084  export protein FliQ  79.78 
 
 
89 aa  133  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  67.44 
 
 
89 aa  113  9e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  67.44 
 
 
89 aa  113  9e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3594  flagellar biosynthetic protein FliQ  67.07 
 
 
89 aa  109  2e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  58.54 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.44 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.1 
 
 
89 aa  96.7  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  57.32 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  57.32 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  59.76 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.25 
 
 
89 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  54.88 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4423  export protein FliQ  58.23 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.844817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.16 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  54.43 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.5 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  52.56 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.63 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  58.54 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.22 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.22 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  84  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.22 
 
 
90 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.63 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.1 
 
 
89 aa  82.8  1e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.25 
 
 
89 aa  82.4  2e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.37 
 
 
89 aa  82  2e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.25 
 
 
89 aa  82.4  2e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.9 
 
 
90 aa  80.9  6e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  80.1  9e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  80.1  9e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  79.7  1e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  79  2e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0166  flagellar biosynthetic protein FliQ, putative  50.63 
 
 
90 aa  73.2  1e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.48 
 
 
89 aa  72  2e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.23 
 
 
83 aa  72  3e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.03 
 
 
89 aa  71.2  4e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  67.4  6e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.03 
 
 
89 aa  67  8e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.3 
 
 
89 aa  65.5  2e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  45 
 
 
89 aa  65.9  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1262  flagellar biosynthesis protein FliQ  45 
 
 
89 aa  65.9  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1618  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  45 
 
 
89 aa  65.9  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.3 
 
 
89 aa  65.5  2e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.12 
 
 
90 aa  65.9  2e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1139  flagellar biosynthesis protein FliQ  45 
 
 
89 aa  65.9  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00184506  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.18 
 
 
91 aa  65.1  3e-10  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.89 
 
 
89 aa  64.7  4e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  50 
 
 
89 aa  64.7  4e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.18 
 
 
89 aa  63.9  6e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  64.3  6e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0576  flagellar biosynthesis protein  38.2 
 
 
89 aa  63.9  7e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3388  export protein FliQ  58.7 
 
 
90 aa  63.5  9e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0244  lateral flagellar export/assembly protein LfiQ  58.7 
 
 
90 aa  63.5  9e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.58 
 
 
89 aa  63.5  1e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.46 
 
 
89 aa  63.2  1e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.04 
 
 
89 aa  62.4  2e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.09 
 
 
89 aa  62.8  2e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.09 
 
 
89 aa  62  3e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.56 
 
 
89 aa  62  3e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.96 
 
 
89 aa  61.6  3e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
89 aa  61.6  4e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0741  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.15 
 
 
89 aa  60.8  5e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.153743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.26 
 
 
89 aa  61.2  5e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.54 
 
 
89 aa  61.2  5e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2161  flagellar biosynthesis protein FliQ  54.24 
 
 
89 aa  60.8  7e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.46 
 
 
89 aa  60.5  8e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.55 
 
 
89 aa  59.7  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.08 
 
 
91 aa  60.1  1e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1356  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.09 
 
 
89 aa  59.7  1e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.55 
 
 
89 aa  59.7  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.27 
 
 
88 aa  59.7  1e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.62 
 
 
89 aa  59.7  1e-08  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.9 
 
 
89 aa  60.1  1e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  59.7  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.07 
 
 
89 aa  59.3  2e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.96508e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2143  flagellar biosynthesis protein FliQ  45 
 
 
89 aa  58.9  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.133607  hitchhiker  0.00525204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1235  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.07 
 
 
89 aa  59.3  2e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102862  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1699  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.07 
 
 
89 aa  59.3  2e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.86094e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.46 
 
 
89 aa  58.9  2e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.55 
 
 
89 aa  58.9  2e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1551  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.33 
 
 
89 aa  58.9  2e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1070  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.07 
 
 
89 aa  59.3  2e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.48422e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2726  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.07 
 
 
89 aa  59.3  2e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00753995  normal  0.443134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>