255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0083 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  60.07 
 
 
558 aa  672  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  58.48 
 
 
558 aa  655  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
566 aa  1161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  72.81 
 
 
570 aa  860  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  59.23 
 
 
565 aa  660  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  46.18 
 
 
583 aa  471  1e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  46.11 
 
 
569 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  39.13 
 
 
582 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4417  flagellar MS-ring protein  36.42 
 
 
559 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.411819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0234  flagellar MS-ring protein  34.67 
 
 
546 aa  320  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.151863  normal  0.235707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0711  flagellar MS-ring protein  34.67 
 
 
546 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.633063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0631  flagellar MS-ring protein  34.49 
 
 
546 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  34.12 
 
 
556 aa  306  6e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0250  flagellar MS-ring protein  34.81 
 
 
548 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  32.88 
 
 
597 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  33.56 
 
 
598 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  33.45 
 
 
592 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3382  flagellar MS-ring protein  34.01 
 
 
548 aa  296  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.275908  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  33.11 
 
 
592 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  33.45 
 
 
592 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4655  flagellar MS-ring protein  36.04 
 
 
548 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702143  normal  0.459158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  33.73 
 
 
592 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  31.88 
 
 
594 aa  287  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  33.67 
 
 
595 aa  285  1e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  32.36 
 
 
594 aa  283  8e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  33.58 
 
 
568 aa  281  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0171  flagellar MS-ring protein  35.1 
 
 
551 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0223  flagellar MS-ring protein  35.03 
 
 
532 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  31.84 
 
 
544 aa  269  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  31.84 
 
 
544 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  32.7 
 
 
594 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  31.94 
 
 
558 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  31.56 
 
 
552 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  34.21 
 
 
561 aa  260  5e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  32.37 
 
 
567 aa  249  9e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  32.01 
 
 
580 aa  247  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  31.44 
 
 
590 aa  246  5e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  30.47 
 
 
611 aa  236  1e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  28.86 
 
 
552 aa  234  2e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  31.54 
 
 
584 aa  234  4e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.52 
 
 
611 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.52 
 
 
611 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
570 aa  229  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
570 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  32.17 
 
 
579 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.62191e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  32.17 
 
 
579 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  32.17 
 
 
579 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  28.52 
 
 
587 aa  226  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  29.81 
 
 
603 aa  226  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  32.58 
 
 
563 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 
579 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  32.98 
 
 
570 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  31.91 
 
 
576 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  31.63 
 
 
568 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  33.19 
 
 
574 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  33.19 
 
 
574 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.31 
 
 
600 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  33.55 
 
 
560 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  31.74 
 
 
560 aa  223  5e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  31.74 
 
 
560 aa  223  5e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  31.74 
 
 
560 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 
552 aa  223  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 
552 aa  222  2e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  31.75 
 
 
552 aa  222  2e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  29.31 
 
 
587 aa  221  2e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  31.74 
 
 
560 aa  222  2e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 
552 aa  222  2e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  32.17 
 
 
566 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  29.34 
 
 
593 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  33.26 
 
 
563 aa  220  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  29.13 
 
 
587 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 
552 aa  220  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  33.11 
 
 
571 aa  220  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.52 
 
 
552 aa  219  9e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  33.42 
 
 
587 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  33.42 
 
 
587 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  32.24 
 
 
565 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  33.42 
 
 
587 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  30.44 
 
 
677 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.65 
 
 
567 aa  218  3e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  30.07 
 
 
568 aa  218  3e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  33.42 
 
 
587 aa  217  6e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  34.59 
 
 
562 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  32.73 
 
 
598 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  32.73 
 
 
598 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  32.73 
 
 
598 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1287  flagellar M-ring protein FliF  32.88 
 
 
578 aa  215  2e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.930135  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  29.79 
 
 
548 aa  214  3e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  32.37 
 
 
569 aa  213  5e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03162  flagellar MS-ring protein  29.33 
 
 
580 aa  213  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002815  flagellar M-ring protein FliF  28.86 
 
 
580 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  31.26 
 
 
560 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  30.28 
 
 
566 aa  212  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  30.6 
 
 
594 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  32.5 
 
 
598 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  31.88 
 
 
553 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  32.5 
 
 
598 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  32.5 
 
 
598 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  32.5 
 
 
598 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  31.93 
 
 
561 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.505742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>