137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0081 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  65.74 
 
 
252 aa  341  6e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  63.03 
 
 
236 aa  305  5e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  61.02 
 
 
235 aa  299  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  64.32 
 
 
235 aa  296  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  37.19 
 
 
251 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  38.86 
 
 
224 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  35.39 
 
 
230 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  33.19 
 
 
238 aa  136  3e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  33.19 
 
 
238 aa  136  3e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  33.19 
 
 
238 aa  134  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  31.7 
 
 
236 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  30.8 
 
 
236 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  31.12 
 
 
242 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  32.66 
 
 
241 aa  120  1e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  29.52 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 
295 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  32.62 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  30.27 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  29.73 
 
 
266 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  30.37 
 
 
334 aa  86.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  25.53 
 
 
225 aa  85.1  1e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  28 
 
 
296 aa  84.3  2e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  32.78 
 
 
252 aa  84.3  2e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  31.71 
 
 
267 aa  84  2e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  29.32 
 
 
324 aa  83.6  3e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  30 
 
 
231 aa  80.9  2e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 
243 aa  79.7  4e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  27.54 
 
 
268 aa  79.3  5e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  33.13 
 
 
254 aa  79.3  5e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  28.65 
 
 
260 aa  79.3  5e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
270 aa  79.3  5e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  30.29 
 
 
242 aa  79  7e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  32.61 
 
 
266 aa  79  7e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  28.57 
 
 
307 aa  77.4  2e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  32.53 
 
 
260 aa  77.8  2e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  31.55 
 
 
264 aa  77.4  2e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  27.98 
 
 
316 aa  76.3  5e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  31.33 
 
 
263 aa  75.9  6e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  29.65 
 
 
268 aa  74.7  1e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  26.38 
 
 
403 aa  73.9  2e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 
265 aa  73.2  4e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.8 
 
 
233 aa  72  8e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  29.78 
 
 
349 aa  71.2  2e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  30 
 
 
245 aa  70.5  2e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  29.09 
 
 
318 aa  70.1  3e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  30.77 
 
 
303 aa  69.3  5e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  27.04 
 
 
338 aa  68.9  8e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  26.24 
 
 
316 aa  68.2  1e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  27.04 
 
 
338 aa  67.4  2e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  27.04 
 
 
338 aa  67  2e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  28.34 
 
 
248 aa  67.4  2e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  27.04 
 
 
338 aa  67.4  2e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  26.45 
 
 
245 aa  66.6  3e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  26.45 
 
 
245 aa  66.6  3e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  29.79 
 
 
272 aa  65.9  6e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 
339 aa  65.9  6e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  29.41 
 
 
272 aa  64.7  1e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  27.8 
 
 
320 aa  65.1  1e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  26.48 
 
 
316 aa  64.7  1e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  27.18 
 
 
300 aa  64.3  2e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  27.44 
 
 
316 aa  64.3  2e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  28.99 
 
 
227 aa  64.3  2e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  26.58 
 
 
375 aa  62.8  5e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  23.76 
 
 
262 aa  62.8  5e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  28.31 
 
 
201 aa  59.7  4e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  27.74 
 
 
209 aa  58.9  7e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  26.14 
 
 
231 aa  58.9  8e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  28.4 
 
 
251 aa  58.2  1e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.01 
 
 
262 aa  57.8  2e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  25.26 
 
 
207 aa  57.8  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  23.88 
 
 
228 aa  57.8  2e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  24.14 
 
 
251 aa  56.6  3e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  29.55 
 
 
244 aa  57  3e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  29.55 
 
 
244 aa  57  3e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  26.04 
 
 
226 aa  56.6  4e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  30.6 
 
 
234 aa  56.6  4e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  28.48 
 
 
227 aa  55.8  6e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  30.77 
 
 
261 aa  55.8  6e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  26.54 
 
 
225 aa  55.8  6e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  23.53 
 
 
226 aa  55.8  7e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  23.53 
 
 
226 aa  55.8  7e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  23.53 
 
 
226 aa  55.8  7e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  23.53 
 
 
226 aa  55.8  7e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  23.53 
 
 
226 aa  55.8  7e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  23.53 
 
 
226 aa  55.8  7e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  23.7 
 
 
276 aa  55.5  8e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  27.88 
 
 
227 aa  55.5  9e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  26.22 
 
 
268 aa  55.5  9e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  25.93 
 
 
227 aa  55.1  1e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  26.79 
 
 
247 aa  55.1  1e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  23.32 
 
 
225 aa  55.1  1e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  32.06 
 
 
280 aa  54.3  2e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  34.69 
 
 
237 aa  54.3  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  27.88 
 
 
227 aa  53.9  2e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  22.99 
 
 
226 aa  53.5  3e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  23.88 
 
 
228 aa  53.1  4e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  25.93 
 
 
268 aa  53.1  4e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  25.14 
 
 
227 aa  53.1  4e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  23.88 
 
 
228 aa  52.8  5e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>