17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0078 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  300  6e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0072  hypothetical protein  60.56 
 
 
145 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3471  hypothetical protein  52.03 
 
 
151 aa  140  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.370785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  53.1 
 
 
151 aa  139  1e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3654  hypothetical protein  49.29 
 
 
154 aa  125  2e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04906  hypothetical protein  31.5 
 
 
145 aa  68.2  4e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4411  hypothetical protein  29.01 
 
 
148 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0602809 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0229  hypothetical protein  31.3 
 
 
141 aa  57.4  7e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0716  hypothetical protein  31.3 
 
 
141 aa  57.4  7e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0636  putative flagellar protein FlgN  31.3 
 
 
141 aa  56.6  1e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3374  hypothetical protein  30.53 
 
 
142 aa  53.9  8e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0260  lateral flagellar chaperone protein LfgN  30.53 
 
 
142 aa  53.5  1e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000743  LfgN  29.92 
 
 
145 aa  49.3  2e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1212  FlgN family protein  29.92 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.783285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  30.25 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  29.41 
 
 
155 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  29.41 
 
 
155 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>