More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0072 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
402 aa  802  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  77.72 
 
 
398 aa  607  1e-172  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  70.65 
 
 
402 aa  584  1e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  71.14 
 
 
395 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  70.65 
 
 
395 aa  552  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  51.99 
 
 
399 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  51.24 
 
 
398 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  48.76 
 
 
398 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  47.54 
 
 
400 aa  359  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  47.54 
 
 
400 aa  358  9e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  47.41 
 
 
395 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  41.01 
 
 
413 aa  312  8e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  41.42 
 
 
402 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  40.23 
 
 
438 aa  309  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  39.57 
 
 
462 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  39.57 
 
 
462 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4674  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  42.01 
 
 
389 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  42.48 
 
 
405 aa  293  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  42.51 
 
 
404 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  40.27 
 
 
440 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  39.28 
 
 
410 aa  278  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  40.05 
 
 
440 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  41.4 
 
 
383 aa  274  2e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  38.11 
 
 
408 aa  272  6e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  40.69 
 
 
395 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  41.18 
 
 
395 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  38.24 
 
 
443 aa  267  3e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  39.08 
 
 
407 aa  266  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  39.08 
 
 
407 aa  266  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  39.25 
 
 
451 aa  266  6e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  36.52 
 
 
420 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  39.42 
 
 
406 aa  262  9e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  40.49 
 
 
407 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  37.61 
 
 
442 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  39.81 
 
 
418 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.8 
 
 
418 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  37.86 
 
 
407 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  38.93 
 
 
408 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  39.95 
 
 
403 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  39.95 
 
 
403 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  39.95 
 
 
403 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  37.08 
 
 
442 aa  254  2e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  39.71 
 
 
403 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  39.71 
 
 
403 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  39.95 
 
 
401 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  37.79 
 
 
425 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  39.07 
 
 
399 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  39.71 
 
 
401 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  36.12 
 
 
453 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  39.71 
 
 
401 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  39.41 
 
 
402 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  39.71 
 
 
401 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  35.6 
 
 
441 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.02 
 
 
430 aa  250  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  35.32 
 
 
453 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  39.16 
 
 
402 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  39.16 
 
 
402 aa  249  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  39.16 
 
 
402 aa  249  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  35.75 
 
 
455 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
453 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  35.9 
 
 
453 aa  246  5e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  35.32 
 
 
453 aa  246  5e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
453 aa  246  5e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  36.34 
 
 
453 aa  246  7e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  36.34 
 
 
453 aa  246  7e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  36.34 
 
 
453 aa  246  7e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 
460 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  35.9 
 
 
453 aa  245  1e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  37 
 
 
428 aa  244  2e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  38.78 
 
 
405 aa  244  2e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  37 
 
 
428 aa  244  2e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  37 
 
 
428 aa  244  2e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  35.1 
 
 
453 aa  242  8e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  38.46 
 
 
410 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  35.44 
 
 
401 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  37.15 
 
 
425 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  34.57 
 
 
454 aa  240  3e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  38.94 
 
 
404 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  37.08 
 
 
414 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  38.97 
 
 
404 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  37.08 
 
 
414 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  37.08 
 
 
414 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.85 
 
 
426 aa  236  5e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  35.22 
 
 
459 aa  234  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  34.47 
 
 
401 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  38.2 
 
 
405 aa  233  4e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  37.08 
 
 
413 aa  233  4e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  34.73 
 
 
453 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.5 
 
 
423 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  34.08 
 
 
437 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  34.08 
 
 
437 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  36.6 
 
 
413 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  36.6 
 
 
413 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  36.6 
 
 
413 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  36.6 
 
 
413 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  35.89 
 
 
413 aa  226  5e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  37.98 
 
 
405 aa  226  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  36.12 
 
 
413 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  36.12 
 
 
413 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  36.12 
 
 
413 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>