More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0070 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  100 
 
 
261 aa  524  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  88.51 
 
 
261 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  83.91 
 
 
261 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  83.91 
 
 
261 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  83.14 
 
 
261 aa  451  1e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  66.28 
 
 
261 aa  359  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  60.92 
 
 
261 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  60.92 
 
 
261 aa  333  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  60.38 
 
 
261 aa  329  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  60.92 
 
 
261 aa  327  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3366  flagellar basal body rod protein FlgG  57.47 
 
 
261 aa  322  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0268  flagellar basal body rod protein FlgG  57.47 
 
 
261 aa  321  7e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  58.62 
 
 
261 aa  317  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0242  flagellar basal body rod protein FlgG  58.08 
 
 
262 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0189  flagellar basal body rod protein FlgG  58.08 
 
 
262 aa  314  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000735  flagellar basal-body rod protein FlgG  64.61 
 
 
243 aa  313  2e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  59 
 
 
261 aa  313  3e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  59 
 
 
261 aa  313  3e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  59.39 
 
 
261 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  56.32 
 
 
261 aa  302  4e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  55.56 
 
 
261 aa  292  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.26 
 
 
262 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  56.42 
 
 
262 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  55.38 
 
 
261 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  54.41 
 
 
261 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  54.02 
 
 
261 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  55.04 
 
 
261 aa  286  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  55.17 
 
 
261 aa  286  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  54.41 
 
 
261 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  55.04 
 
 
261 aa  286  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.04 
 
 
261 aa  285  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  53.64 
 
 
261 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1787  flagellar basal body rod protein FlgG  54.96 
 
 
262 aa  284  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.96 
 
 
262 aa  284  1e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004168  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.91 
 
 
262 aa  284  1e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  54.58 
 
 
262 aa  283  2e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.91 
 
 
262 aa  283  2e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2333  flagellar basal body rod protein FlgG  54.2 
 
 
262 aa  283  3e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0515  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.9 
 
 
261 aa  280  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01292  flagellar basal body rod protein FlgG  51.15 
 
 
262 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1166  flagellar basal body rod protein FlgG  51.53 
 
 
262 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1602  flagellar basal body rod protein FlgG  51.91 
 
 
262 aa  275  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1421  flagellar basal body rod protein FlgG  51.15 
 
 
262 aa  273  1e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2942  flagellar basal body rod protein FlgG  51.15 
 
 
262 aa  273  1e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3578  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.57 
 
 
261 aa  273  2e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.87 
 
 
263 aa  273  2e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2957  flagellar basal body rod protein FlgG  50.76 
 
 
262 aa  273  2e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.711703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2592  flagellar basal body rod protein FlgG  50.76 
 
 
262 aa  272  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2313  flagellar basal body rod protein FlgG  51.53 
 
 
262 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  51.74 
 
 
260 aa  272  4e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  53.33 
 
 
262 aa  271  5e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1350  flagellar basal body rod protein FlgG  50.38 
 
 
262 aa  272  5e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3244  flagellar basal body rod protein FlgG  50.38 
 
 
262 aa  271  5e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  51.15 
 
 
262 aa  272  5e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1264  flagellar basal body rod protein FlgG  50.38 
 
 
262 aa  271  8e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  50.76 
 
 
262 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3082  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
262 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
262 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.898516  normal  0.0829972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1482  flagellar basal body rod protein FlgG  49.62 
 
 
262 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.655215  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1334  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
262 aa  269  3e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1345  flagellar basal body rod protein FlgG  49.24 
 
 
262 aa  268  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.19 
 
 
260 aa  265  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.19 
 
 
260 aa  265  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  50.57 
 
 
261 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  50.57 
 
 
261 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  51.74 
 
 
260 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.35 
 
 
260 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4891e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  51.35 
 
 
260 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  51.35 
 
 
260 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.03 
 
 
262 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.19 
 
 
260 aa  262  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2965  flagellar basal body rod protein FlgG  52.12 
 
 
260 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22311  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  51.35 
 
 
260 aa  262  5e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  51.74 
 
 
260 aa  261  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.42 
 
 
260 aa  261  9e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.19 
 
 
260 aa  261  9e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.81 
 
 
260 aa  260  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.03 
 
 
260 aa  260  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.81 
 
 
260 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02923  flagellar basal body rod protein FlgG  48.63 
 
 
262 aa  258  5e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 
260 aa  258  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  50.97 
 
 
260 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 
260 aa  258  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 
260 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  50.97 
 
 
260 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 
260 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.97 
 
 
260 aa  258  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 
260 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 
260 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 
260 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 
260 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 
260 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  49.81 
 
 
260 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 
260 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  49.81 
 
 
262 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  50.58 
 
 
260 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 
260 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 
260 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1469  hypothetical protein  50.77 
 
 
263 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.37 
 
 
263 aa  256  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>