88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0067 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0067  peptidoglycan hydrolase  100 
 
 
140 aa  288  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0061  peptidoglycan hydrolase  77.93 
 
 
145 aa  223  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3643  peptidoglycan hydrolase  65.96 
 
 
139 aa  177  5e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3963  peptidoglycan hydrolase  62.32 
 
 
135 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3460  peptidoglycan hydrolase  60.14 
 
 
135 aa  157  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000732  flagellar protein FlgJ  42.86 
 
 
182 aa  94  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04917  putative flagellar protein FlgJ  45.54 
 
 
182 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  40 
 
 
316 aa  78.6  2e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3570  putative flagellar protein FlgJ  39.36 
 
 
127 aa  71.6  3e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409838  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0219  peptidoglycan hydrolase  40.48 
 
 
97 aa  66.6  1e-10  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0647  peptidoglycan hydrolase  40.24 
 
 
97 aa  64.7  4e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3241  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.96 
 
 
384 aa  63.9  6e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  43.16 
 
 
318 aa  63.9  7e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 
374 aa  63.9  7e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  47.14 
 
 
269 aa  62  2e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1267  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41 
 
 
384 aa  61.2  4e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1337  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41 
 
 
384 aa  61.6  4e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.75524  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3079  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.61 
 
 
337 aa  61.6  4e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2939  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.37 
 
 
380 aa  60.5  8e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1424  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.37 
 
 
380 aa  60.5  8e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.37 
 
 
380 aa  60.5  8e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2954  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.37 
 
 
380 aa  60.5  8e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.36 
 
 
291 aa  60.1  9e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2589  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40 
 
 
385 aa  59.7  1e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1348  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.29 
 
 
363 aa  59.7  1e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1329  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40 
 
 
389 aa  59.3  2e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0311212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  39.53 
 
 
379 aa  58.9  2e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1605  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
336 aa  58.9  2e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202328  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1353  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38 
 
 
341 aa  58.5  3e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3363  rod binding protein-like protein  36.62 
 
 
99 aa  57.4  6e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0271  lateral flagellar peptidoglycan hydrolase LfgJ  36.62 
 
 
99 aa  57.4  7e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.697145 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.51 
 
 
291 aa  56.6  1e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2310  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.71 
 
 
372 aa  56.2  1e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01295  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.26 
 
 
308 aa  55.1  4e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004165  flagellar protein FlgJ  37.97 
 
 
307 aa  53.9  8e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1110  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.87 
 
 
328 aa  53.5  9e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197589  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3723  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.77 
 
 
388 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1473  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.93 
 
 
384 aa  53.5  1e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4382  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.35 
 
 
384 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3943  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.04 
 
 
384 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.78 
 
 
430 aa  52.8  2e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.78 
 
 
353 aa  52.4  2e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1466  flagellar biosynthesis  31.73 
 
 
155 aa  52  2e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.74 
 
 
400 aa  50.8  6e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.74 
 
 
400 aa  50.8  6e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1311  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.93 
 
 
367 aa  50.4  8e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1943  peptidoglycan hydrolase FlgJ  40.85 
 
 
416 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0130803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2962  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.93 
 
 
318 aa  49.3  2e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1169  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.63 
 
 
377 aa  48.5  3e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0546909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.56 
 
 
394 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1784  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.21 
 
 
312 aa  48.1  4e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.01 
 
 
352 aa  47.8  5e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3472  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.44 
 
 
414 aa  47.4  6e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.603408  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01004  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.23 
 
 
392 aa  47  8e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06162  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.23 
 
 
392 aa  47  8e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5633  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.98 
 
 
348 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  38.16 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.66 
 
 
294 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35 
 
 
314 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2417  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35 
 
 
314 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112491  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1294  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.4 
 
 
316 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  hitchhiker  0.00280801 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2316  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35 
 
 
314 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.58 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00375392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.21 
 
 
332 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2047  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  28.93 
 
 
313 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.277131  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1250  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.58 
 
 
316 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.379236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1279  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.58 
 
 
316 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.814453  hitchhiker  0.00560108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2190  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.58 
 
 
316 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367397 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  33.7 
 
 
610 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1898  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
399 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1533  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.16 
 
 
325 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01085  hypothetical protein  32.22 
 
 
313 aa  42  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188745  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2330  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.65 
 
 
332 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2565  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.22 
 
 
313 aa  42  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.22 
 
 
313 aa  42  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.592055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.22 
 
 
313 aa  42  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0662676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1460  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.22 
 
 
313 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.969398  hitchhiker  1.47806e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2519  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.22 
 
 
313 aa  42  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01077  flagellar biosynthesis protein FlgJ  32.22 
 
 
313 aa  42  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0248  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.03 
 
 
310 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1876  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.62 
 
 
320 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.803787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4191  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.82 
 
 
327 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3575  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.53 
 
 
328 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2590  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.76 
 
 
320 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33 
 
 
317 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.650654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3742  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.57 
 
 
340 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.412166  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1263  rod binding-like protein  30.95 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.346021  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  34.12 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>