225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0065 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
305 aa  624  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  77.05 
 
 
305 aa  495  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  62.3 
 
 
305 aa  408  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  62.95 
 
 
305 aa  404  1e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  60.98 
 
 
305 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  37.79 
 
 
305 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  34.43 
 
 
299 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  33.44 
 
 
299 aa  179  6e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  33.12 
 
 
309 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  32.27 
 
 
304 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  7.47775e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  32.15 
 
 
309 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  30.16 
 
 
300 aa  147  1e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  34.57 
 
 
439 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0194  flagellar hook-associated protein FlgL  29.39 
 
 
304 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0247  flagellar hook-associated protein FlgL  29.07 
 
 
304 aa  119  8e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  27.01 
 
 
302 aa  118  1e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  29.68 
 
 
296 aa  118  1e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  32.52 
 
 
410 aa  118  1e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  34.66 
 
 
562 aa  115  8e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  32.14 
 
 
433 aa  114  1e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  32.97 
 
 
412 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  28.16 
 
 
304 aa  113  4e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.21 
 
 
311 aa  111  1e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.61 
 
 
326 aa  111  2e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  31.14 
 
 
408 aa  110  4e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0217  flagellar hook-associated protein FlgL  28.07 
 
 
307 aa  109  4e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  32.99 
 
 
404 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0649  flagellar hook-associated protein FlgL  28.37 
 
 
305 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  32.61 
 
 
411 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  30.9 
 
 
521 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  32.95 
 
 
401 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  33.33 
 
 
400 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  25.08 
 
 
326 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  25.08 
 
 
326 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  32.07 
 
 
411 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  30.94 
 
 
521 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  32.22 
 
 
524 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  32.13 
 
 
396 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  35.33 
 
 
523 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  29.12 
 
 
408 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  30.11 
 
 
396 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  31.61 
 
 
403 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  26.03 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  30.05 
 
 
396 aa  95.9  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  28.96 
 
 
416 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  29.35 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  29.56 
 
 
530 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  32.46 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  28.49 
 
 
400 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  28.8 
 
 
402 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  26.92 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  25.35 
 
 
341 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.73 
 
 
420 aa  93.2  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  27.57 
 
 
411 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  27.08 
 
 
404 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  27.57 
 
 
411 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  29.52 
 
 
411 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  26.48 
 
 
317 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  23.72 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  27.45 
 
 
520 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  25.47 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  25.86 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  25.86 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  25.86 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  30.53 
 
 
397 aa  89.7  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  22.4 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  28.81 
 
 
400 aa  89.4  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  26.17 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  4.76574e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  25.16 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  30.68 
 
 
401 aa  89  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  30.68 
 
 
401 aa  89  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  25.32 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  26.1 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  27.17 
 
 
406 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  25.7 
 
 
317 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  29.59 
 
 
401 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 
317 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.79805e-05 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  27.67 
 
 
248 aa  86.3  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 
317 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.01663e-05 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  29.48 
 
 
396 aa  86.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 
317 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 
317 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  28.85 
 
 
438 aa  85.9  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  25.81 
 
 
298 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  27.44 
 
 
401 aa  85.5  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  20.78 
 
 
301 aa  85.5  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  25.23 
 
 
317 aa  85.1  1e-15  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  22.3 
 
 
297 aa  85.1  1e-15  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  27.03 
 
 
410 aa  84.7  2e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  27.03 
 
 
410 aa  84.7  2e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  28.92 
 
 
410 aa  84.3  2e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  25.24 
 
 
298 aa  84.7  2e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  27.03 
 
 
410 aa  84.7  2e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  27.03 
 
 
410 aa  84.7  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  27.03 
 
 
410 aa  84.7  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  27.03 
 
 
410 aa  84.3  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  27.03 
 
 
410 aa  84.7  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  24.17 
 
 
315 aa  82.8  6e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  25.26 
 
 
301 aa  82.8  6e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>