175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0061 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  100 
 
 
126 aa  263  6e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  84.92 
 
 
126 aa  229  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  77.78 
 
 
126 aa  185  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  76.19 
 
 
126 aa  184  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  71.43 
 
 
126 aa  172  1e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  50 
 
 
128 aa  127  4e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  48.31 
 
 
128 aa  126  1e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  45.97 
 
 
132 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  39.68 
 
 
130 aa  107  4e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  39.68 
 
 
130 aa  107  4e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0656  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
127 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  39.83 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  36.51 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0206  flagellar protein FliS  39.13 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  38.66 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0229  flagellar protein FliS  38.66 
 
 
128 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  36.44 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  36.13 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  33.9 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3585  flagellar protein FliS  35.25 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  35.59 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  36.44 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  32.17 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  34.92 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
134 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  34.78 
 
 
145 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
136 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
153 aa  83.2  1e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  35.96 
 
 
144 aa  82.4  2e-15  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  33.88 
 
 
126 aa  82.8  2e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  31.67 
 
 
135 aa  82  3e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  31.67 
 
 
135 aa  82  3e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  31.67 
 
 
135 aa  82  3e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  31.67 
 
 
135 aa  81.6  3e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  31.67 
 
 
135 aa  82  3e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  7.06832e-07 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  32.2 
 
 
132 aa  80.9  6e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
136 aa  80.5  7e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  35.96 
 
 
136 aa  80.5  8e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  33.9 
 
 
135 aa  80.1  9e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
132 aa  78.2  3e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  78.6  3e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  78.6  3e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
136 aa  78.2  3e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
132 aa  78.2  3e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
133 aa  77.8  4e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  27.83 
 
 
136 aa  77.4  5e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
136 aa  77.4  5e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
136 aa  77.4  5e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  27.83 
 
 
136 aa  77.4  5e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  33.62 
 
 
136 aa  77  8e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.06 
 
 
134 aa  77  8e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  33.62 
 
 
136 aa  76.6  1e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  30.43 
 
 
136 aa  76.6  1e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
136 aa  76.3  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
132 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  36.44 
 
 
136 aa  75.9  2e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
133 aa  75.9  2e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  34.82 
 
 
138 aa  75.5  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  30.43 
 
 
133 aa  75.5  2e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
132 aa  76.3  2e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  26.09 
 
 
136 aa  75.1  3e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  75.5  3e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  31.67 
 
 
140 aa  74.7  4e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50250  flagellar protein FliS  36.21 
 
 
126 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194402  decreased coverage  9.00366e-05 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  29.13 
 
 
140 aa  74.7  4e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  31.67 
 
 
140 aa  74.7  4e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  29.82 
 
 
135 aa  74.7  4e-13  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  28.81 
 
 
136 aa  74.3  5e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  27.83 
 
 
136 aa  74.3  5e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
137 aa  73.6  9e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  31.97 
 
 
144 aa  73.6  9e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  35.96 
 
 
132 aa  72.8  1e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  24.35 
 
 
136 aa  73.6  1e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  73.2  1e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  31.15 
 
 
144 aa  72.8  1e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  26.09 
 
 
137 aa  72.4  2e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
135 aa  72.4  2e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
140 aa  72  3e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1952  flagellar protein FliS  31.97 
 
 
129 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  30.36 
 
 
131 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3463  flagellar protein FliS  32.79 
 
 
129 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.220279  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  30.33 
 
 
144 aa  70.5  8e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
129 aa  69.7  1e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  28.21 
 
 
136 aa  69.7  1e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
136 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  32.8 
 
 
146 aa  68.9  2e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  31.9 
 
 
139 aa  68.6  3e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
136 aa  67.8  5e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
136 aa  67.8  5e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
136 aa  67.8  6e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
136 aa  67.8  6e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
136 aa  67.8  6e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
136 aa  67.8  6e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  28.93 
 
 
134 aa  66.6  1e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  29.27 
 
 
144 aa  66.2  1e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
154 aa  65.5  2e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  26.19 
 
 
152 aa  65.5  2e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3936  flagellar protein FliS  28.46 
 
 
133 aa  65.5  2e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  29.46 
 
 
139 aa  65.5  3e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  31.2 
 
 
146 aa  65.5  3e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>