77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0059 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  100 
 
 
390 aa  776  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  42.82 
 
 
383 aa  221  2e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  57.62 
 
 
395 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  66.09 
 
 
438 aa  172  8e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  41.76 
 
 
393 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  31.51 
 
 
351 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  34.03 
 
 
357 aa  86.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0189  flagellar hook-length control protein  39.29 
 
 
352 aa  74.7  3e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511537  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  35.25 
 
 
527 aa  73.2  7e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  35.25 
 
 
579 aa  72  2e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  34.43 
 
 
585 aa  71.2  3e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  34.43 
 
 
586 aa  70.1  6e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
334 aa  69.7  9e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  37.11 
 
 
512 aa  65.5  1e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 
491 aa  65.1  2e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  38.3 
 
 
568 aa  65.1  2e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  29.63 
 
 
324 aa  64.3  4e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  35 
 
 
508 aa  62.4  1e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  36.9 
 
 
718 aa  61.2  3e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  36.9 
 
 
537 aa  61.2  3e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  36.9 
 
 
702 aa  61.2  3e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  36.9 
 
 
717 aa  61.2  3e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  35.48 
 
 
544 aa  60.1  7e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
495 aa  57  6e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  40 
 
 
434 aa  55.5  2e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0204  flagellar hook-length control protein  32.05 
 
 
361 aa  55.5  2e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.504865 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0658  flagellar hook-length control protein  30.77 
 
 
365 aa  55.1  2e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  40 
 
 
434 aa  55.5  2e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0280  lateral flagellar hook length control protein LafE  38.67 
 
 
353 aa  54.7  3e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00112639  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  36.36 
 
 
674 aa  54.7  3e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  34.18 
 
 
487 aa  53.9  4e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  31.4 
 
 
460 aa  54.3  4e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3354  flagellar hook-length control protein  38.67 
 
 
353 aa  53.5  6e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.26505  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  32.89 
 
 
428 aa  53.1  7e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  32.89 
 
 
427 aa  53.1  8e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  43.75 
 
 
369 aa  52.4  1e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  31.43 
 
 
686 aa  52.4  2e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  28 
 
 
656 aa  51.6  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  34.09 
 
 
593 aa  51.2  3e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  30.48 
 
 
623 aa  49.7  8e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  38.57 
 
 
389 aa  49.7  8e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  46.15 
 
 
408 aa  49.7  9e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  32.32 
 
 
609 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2137  flagellar hook-length control protein  35.42 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000644258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  40.3 
 
 
570 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2190  flagellar hook-length control protein  36.46 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.543478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2132  flagellar hook-length control protein  35.42 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  39.09 
 
 
567 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1268  flagellar hook-length control protein  36.46 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1145  flagellar hook-length control protein  35.42 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2534  flagellar hook-length control protein  34.94 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.658569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  29.27 
 
 
768 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  35.48 
 
 
478 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1507  putative flagellar hook-length control protein  28.38 
 
 
660 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.838135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  42.31 
 
 
580 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  31.43 
 
 
660 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  36.71 
 
 
364 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  26.92 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  35.71 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0179  flagellar hook-length control protein, putative  33.33 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.501207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  32.93 
 
 
485 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  41.18 
 
 
430 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2719  flagellar hook-length control protein  34.25 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.243255  normal  0.82206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  36 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  41.18 
 
 
604 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2043  flagellar hook-length control protein  34.25 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.436184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2176  flagellar hook-length control protein  34.25 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.64801e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1705  flagellar hook-length control protein  34.25 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.195068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3106  flagellar hook-length control protein  30.23 
 
 
479 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1241  flagellar hook-length control protein  34.25 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.896281  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  34.38 
 
 
431 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1699  flagellar hook-length control protein  34.25 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0151155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  29.56 
 
 
435 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  35.21 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  26.58 
 
 
474 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0231  flagellar hook-length control protein, putative  32.22 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4361  flagellar hook-length control protein  29.01 
 
 
421 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>