More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0055 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
336 aa  694  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  68.15 
 
 
336 aa  506  1e-142  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  58.97 
 
 
330 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3447  OmpA/MotB domain-containing protein  56.43 
 
 
305 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3946  OmpA/MotB domain-containing protein  56.83 
 
 
306 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  40.12 
 
 
330 aa  244  1e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  39.09 
 
 
330 aa  239  6e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  42.23 
 
 
313 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  38.78 
 
 
307 aa  201  2e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  38.78 
 
 
307 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3579  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 
306 aa  186  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0662  hypothetical protein  37.46 
 
 
303 aa  184  2e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0200  hypothetical protein  37.13 
 
 
303 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0382119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0731  hypothetical protein  37.13 
 
 
303 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 
301 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  2.81667e-06 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0154  chemotaxis lafU protein  33.88 
 
 
311 aa  164  2e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0202  chemotaxis LafU protein  34.2 
 
 
311 aa  164  2e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  36.51 
 
 
349 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  35.86 
 
 
341 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  33.77 
 
 
320 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  33.11 
 
 
309 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  33.11 
 
 
309 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  33.11 
 
 
309 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  33.11 
 
 
309 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  3.5e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  33.11 
 
 
309 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.18794e-23 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  32.47 
 
 
316 aa  159  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  32.57 
 
 
290 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.45861e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  33.88 
 
 
347 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  1.55511e-11 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  6.85167e-07 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.95029e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  33.79 
 
 
285 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  35.05 
 
 
319 aa  154  3e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  34.12 
 
 
342 aa  152  6e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  33.79 
 
 
329 aa  152  9e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  32.04 
 
 
355 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  31.35 
 
 
296 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3377  OmpA/MotB domain protein  42.25 
 
 
261 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  31.54 
 
 
345 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  31.67 
 
 
313 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0258  hypothetical protein  42.25 
 
 
256 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0264  hypothetical protein  42.25 
 
 
256 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0275  hypothetical protein  41.71 
 
 
256 aa  149  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  31.67 
 
 
313 aa  149  1e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  32.21 
 
 
327 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  30.54 
 
 
312 aa  146  4e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  34.33 
 
 
339 aa  146  4e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  32.39 
 
 
306 aa  146  4e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  33.77 
 
 
346 aa  145  7e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 
358 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  34.67 
 
 
346 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  34.33 
 
 
350 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  31.31 
 
 
325 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4666  OmpA/MotB domain-containing protein  29.18 
 
 
340 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  31.86 
 
 
377 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  28.62 
 
 
321 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  31.77 
 
 
314 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  32.44 
 
 
376 aa  141  1e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  32.59 
 
 
330 aa  141  2e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  28.53 
 
 
451 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  28.25 
 
 
421 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  31.38 
 
 
360 aa  140  4e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.82 
 
 
318 aa  139  5e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  29.51 
 
 
308 aa  139  5e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  31.85 
 
 
320 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2467  flagellar motor protein MotB  30.15 
 
 
309 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0620427  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  29.87 
 
 
433 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  31.29 
 
 
377 aa  135  1e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0577  OmpA/MotB domain protein  34.49 
 
 
325 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0523993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  32.09 
 
 
298 aa  133  4e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  30.61 
 
 
329 aa  130  2e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1854  OmpA/MotB domain protein  30.79 
 
 
350 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00497305  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  30.03 
 
 
319 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  31.23 
 
 
308 aa  130  4e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  28.91 
 
 
327 aa  129  7e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  30.34 
 
 
318 aa  128  1e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  32.69 
 
 
312 aa  128  1e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  32.69 
 
 
312 aa  127  2e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2612  OmpA/MotB domain protein  30.63 
 
 
350 aa  126  4e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  30.52 
 
 
344 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  30.95 
 
 
369 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03067e-05 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1901  OmpA/MotB domain-containing protein  28.83 
 
 
371 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 
346 aa  123  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  30.98 
 
 
339 aa  122  1e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 
307 aa  122  1e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  30.98 
 
 
339 aa  122  1e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  30.19 
 
 
340 aa  122  1e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  30.19 
 
 
340 aa  122  1e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  30.19 
 
 
340 aa  122  1e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  30.98 
 
 
325 aa  121  2e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1259  OmpA/MotB domain-containing protein  29.9 
 
 
334 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  28.38 
 
 
335 aa  120  4e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  28.33 
 
 
287 aa  118  1e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  29.51 
 
 
286 aa  117  2e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  30.38 
 
 
339 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>