More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0047 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0047  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
386 aa  810  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00668  UDP-bacillosamine synthetase  84.21 
 
 
383 aa  683  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0252  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  79.79 
 
 
381 aa  654  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001802  putative aminotransferase DegT family  80.37 
 
 
383 aa  659  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0171  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  79.79 
 
 
381 aa  654  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2329  pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis  72.03 
 
 
385 aa  591  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3098  UDP-bacillosamine synthetase  70.03 
 
 
385 aa  576  1e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1586  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  68.97 
 
 
382 aa  563  1e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.257863  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2975  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  58.12 
 
 
391 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3119  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  58.12 
 
 
391 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0369  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  61.5 
 
 
389 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0593  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  53.87 
 
 
383 aa  452  1e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  51.88 
 
 
384 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2305  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  50.8 
 
 
383 aa  414  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4084  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  51.98 
 
 
392 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2587  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  49.33 
 
 
383 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0384123  hitchhiker  0.000234634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.02 
 
 
394 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0525  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  51.54 
 
 
395 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1461  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  47.49 
 
 
399 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2405  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.33 
 
 
402 aa  328  7e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12432  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01121  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.47 
 
 
395 aa  316  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0393  aminotransferase  42.2 
 
 
380 aa  309  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1514  aminotransferase  41.67 
 
 
381 aa  308  1e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12411  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  42.55 
 
 
407 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.485468  hitchhiker  0.0071561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4858  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.56 
 
 
395 aa  285  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14101  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  39.22 
 
 
398 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1974  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  43.64 
 
 
384 aa  272  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.953061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5132  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.48 
 
 
380 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0563  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.84 
 
 
381 aa  253  4e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.69 
 
 
389 aa  246  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.61 
 
 
368 aa  245  1e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16970  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.15 
 
 
391 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3387  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.15 
 
 
381 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0950  putative perosamine synthetase  34.93 
 
 
365 aa  238  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.251305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.1 
 
 
368 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.44 
 
 
372 aa  234  2e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.38 
 
 
362 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.25 
 
 
367 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.63 
 
 
365 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5394  aminotransferase family protein  34.38 
 
 
371 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3253  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.25 
 
 
384 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0448  processing protease  36.21 
 
 
363 aa  227  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1203  putative perosamine synthetase  35.65 
 
 
363 aa  227  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0714  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.68 
 
 
375 aa  225  8e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1264  general glycosylation pathway protein  34.83 
 
 
386 aa  225  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.905092  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.05 
 
 
372 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1355  perosamine synthetase, putative  33.52 
 
 
364 aa  224  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0599  general glycosylation pathway protein  34.3 
 
 
386 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1139  general glycosylation pathway protein  34.56 
 
 
386 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.957255  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10738  putative aminotransferase  35.98 
 
 
365 aa  222  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.250686  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  35.1 
 
 
368 aa  221  2e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  33.15 
 
 
367 aa  219  9e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.99 
 
 
379 aa  219  9e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.54 
 
 
387 aa  214  1e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2345  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.19 
 
 
382 aa  215  1e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1257  UDP-4-keto-6-deoxy-GlcNAc C4 aminotransferase  34.56 
 
 
386 aa  214  2e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3048  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.31 
 
 
382 aa  214  3e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0821  hypothetical protein  33.7 
 
 
500 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2521  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.04 
 
 
369 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3986  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.83 
 
 
383 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2633  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.79 
 
 
390 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152572  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0792  hypothetical protein  33.7 
 
 
500 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1213  cell wall biosynthesis enzyme  33.52 
 
 
368 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.578129  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0334  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.04 
 
 
377 aa  202  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  32.42 
 
 
364 aa  202  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.4581e-06 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1969  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.33 
 
 
384 aa  201  1e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.886816  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1573  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.42 
 
 
500 aa  201  2e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0486  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.05 
 
 
403 aa  198  1e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0361  aminotransferase-like  32.79 
 
 
383 aa  196  5e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.75 
 
 
372 aa  196  5e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.97 
 
 
393 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3652  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.79 
 
 
403 aa  196  8e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.33 
 
 
507 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  31.4 
 
 
367 aa  193  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.69 
 
 
371 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.91 
 
 
371 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.91 
 
 
371 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3378  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.29 
 
 
368 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.65764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3059  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.34 
 
 
370 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4223  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.62 
 
 
374 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1998  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.76 
 
 
389 aa  174  2e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1938  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.37 
 
 
397 aa  172  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3898  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.65 
 
 
388 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0364  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.22 
 
 
383 aa  170  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3035  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.8 
 
 
379 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181015  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0056  perosamine synthetase  30.22 
 
 
375 aa  169  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0267366  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.25 
 
 
367 aa  167  3e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.73 
 
 
366 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0874  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.45 
 
 
366 aa  166  6e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0665  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.37 
 
 
378 aa  166  6e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0346  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.95 
 
 
383 aa  166  7e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0229  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.76 
 
 
389 aa  166  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00533175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5255  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.04 
 
 
381 aa  166  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5139  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.84 
 
 
391 aa  164  2e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.73 
 
 
370 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0110  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.01 
 
 
406 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.65 
 
 
364 aa  163  4e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4213  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.97 
 
 
382 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1748  glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.07 
 
 
377 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  27.89 
 
 
591 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>