44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0045 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  897  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  45.05 
 
 
442 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  44.82 
 
 
442 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  43.92 
 
 
441 aa  363  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  45.54 
 
 
429 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  44.44 
 
 
431 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  39.18 
 
 
430 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  40.7 
 
 
435 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  40.7 
 
 
435 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  39.68 
 
 
431 aa  303  3e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  39.35 
 
 
430 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  33.88 
 
 
446 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  27.99 
 
 
440 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  25.93 
 
 
616 aa  70.5  6e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  28.57 
 
 
629 aa  70.1  8e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  22.77 
 
 
758 aa  67.8  4e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
826 aa  67  6e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  21.43 
 
 
470 aa  65.1  2e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  26.72 
 
 
648 aa  64.7  3e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  21 
 
 
671 aa  63.2  9e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  25.88 
 
 
821 aa  62.8  1e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  27.2 
 
 
618 aa  62  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  25.22 
 
 
570 aa  60.8  4e-08  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  23.78 
 
 
823 aa  60.5  5e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  24.83 
 
 
825 aa  60.8  5e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  26.11 
 
 
820 aa  60.5  6e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
822 aa  60.1  8e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  24.77 
 
 
509 aa  55.1  3e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  23.29 
 
 
812 aa  53.5  7e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  24.12 
 
 
822 aa  52.4  1e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  22.57 
 
 
833 aa  51.2  4e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  22.3 
 
 
824 aa  50.8  4e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  24.39 
 
 
578 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  28.92 
 
 
238 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  28.92 
 
 
238 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  25.1 
 
 
871 aa  47  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  28.08 
 
 
242 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  27.09 
 
 
238 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  23.67 
 
 
589 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  24.78 
 
 
626 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
826 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
826 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  24.11 
 
 
608 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  27.71 
 
 
507 aa  43.1  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>