38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0041 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0041  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  184  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000318858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0044  hypothetical protein  67.03 
 
 
92 aa  130  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000282672  normal  0.843809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0048  hypothetical protein  60.87 
 
 
87 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00169454  normal  0.150477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0044  hypothetical protein  54.95 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.93062e-05  hitchhiker  1.02958e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0038  hypothetical protein  53.85 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.59242e-06  hitchhiker  0.000533076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0036  hypothetical protein  53.85 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  1.53863e-05  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0041  hypothetical protein  52.75 
 
 
91 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0041  hypothetical protein  53.19 
 
 
91 aa  81.3  4e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00282046  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0036  hypothetical protein  53.19 
 
 
91 aa  80.9  5e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0051156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0040  hypothetical protein  53.19 
 
 
91 aa  80.9  5e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.15973e-08  unclonable  8.7148e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0040  protein of unknown function DUF1488  53.19 
 
 
91 aa  80.9  6e-15  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00230269  unclonable  3.50952e-12 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0033  hypothetical protein  51.65 
 
 
91 aa  80.1  1e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.98861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3726  hypothetical protein  46.07 
 
 
90 aa  74.3  5e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00243512  hitchhiker  0.00809749 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2462  hypothetical protein  43.82 
 
 
91 aa  72.8  2e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.44431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0035  hypothetical protein  45.05 
 
 
88 aa  68.6  3e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.21106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002068  hypothetical protein  48.35 
 
 
87 aa  67.4  7e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000363608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3474  hypothetical protein  41.76 
 
 
85 aa  65.9  2e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.30828e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03082  hypothetical protein  41.76 
 
 
85 aa  65.9  2e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000257953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0433  protein of unknown function DUF1488  41.76 
 
 
85 aa  65.9  2e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  9.33009e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03131  hypothetical protein  41.76 
 
 
85 aa  65.9  2e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000147061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3664  hypothetical protein  41.76 
 
 
85 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.21368e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0433  hypothetical protein  41.76 
 
 
85 aa  65.9  2e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.0563e-07  normal  0.0164752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3762  hypothetical protein  41.76 
 
 
85 aa  65.9  2e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.35622e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3597  putative periplasmic protein  37.36 
 
 
85 aa  64.3  5e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  1.15268e-05  normal  0.951119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3669  hypothetical protein  40.66 
 
 
85 aa  64.7  5e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00836834  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0053  hypothetical protein  38.46 
 
 
85 aa  64.3  6e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00250701  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00381  hypothetical protein  47.25 
 
 
87 aa  64.3  6e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3596  putative periplasmic protein  37.36 
 
 
85 aa  63.5  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  9.34197e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3767  hypothetical protein  37.36 
 
 
85 aa  63.5  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00207623  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3575  hypothetical protein  38.46 
 
 
85 aa  62.4  2e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.31665e-06  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3704  hypothetical protein  36.26 
 
 
85 aa  62.8  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000244931  normal  0.014665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3962  protein of unknown function DUF1488  35.16 
 
 
85 aa  61.6  3e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0051868  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0035  hypothetical protein  39.56 
 
 
85 aa  60.1  1e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000637046  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0445  protein of unknown function DUF1488  35.87 
 
 
85 aa  57  8e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000417841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0362  protein of unknown function DUF1488  32.97 
 
 
89 aa  55.8  2e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.213184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3783  hypothetical protein  34.07 
 
 
85 aa  55.8  2e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00232531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3712  hypothetical protein  33.7 
 
 
82 aa  49.3  2e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000180356  normal  0.0550435 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0084  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.170525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>