More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0031 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  100 
 
 
199 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  93.53 
 
 
170 aa  332  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0024  peptide deformylase  79.57 
 
 
188 aa  314  5e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  87.8 
 
 
167 aa  306  1e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  86.9 
 
 
168 aa  305  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  86.9 
 
 
169 aa  304  4e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  85.29 
 
 
170 aa  303  1e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  85.29 
 
 
170 aa  303  1e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  85.29 
 
 
170 aa  303  1e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  85.29 
 
 
170 aa  303  1e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.64435e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  85.71 
 
 
168 aa  301  3e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  85.71 
 
 
168 aa  301  3e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  85.71 
 
 
168 aa  301  3e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.96537e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  83.53 
 
 
170 aa  299  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  82.94 
 
 
170 aa  298  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0024  peptide deformylase  81.55 
 
 
170 aa  289  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  64.88 
 
 
169 aa  233  1e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  64.29 
 
 
169 aa  231  7e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  64.29 
 
 
169 aa  221  5e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  63.69 
 
 
170 aa  219  2e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  63.69 
 
 
170 aa  219  2e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  63.31 
 
 
172 aa  219  2e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  62.87 
 
 
171 aa  219  2e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  63.69 
 
 
170 aa  219  2e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  63.31 
 
 
172 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  62.21 
 
 
181 aa  215  3e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  60.95 
 
 
169 aa  215  3e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  61.31 
 
 
170 aa  215  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  62.5 
 
 
169 aa  214  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  62.5 
 
 
169 aa  214  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  62.5 
 
 
169 aa  213  1e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  62.5 
 
 
169 aa  213  1e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.66805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  63.41 
 
 
170 aa  213  1e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  62.5 
 
 
169 aa  213  1e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  62.5 
 
 
169 aa  213  1e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  62.5 
 
 
169 aa  213  1e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  62.5 
 
 
169 aa  213  1e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  62.5 
 
 
169 aa  213  1e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  62.5 
 
 
169 aa  213  1e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  61.9 
 
 
169 aa  212  2e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  61.9 
 
 
169 aa  212  2e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  61.9 
 
 
169 aa  212  2e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  61.9 
 
 
169 aa  212  2e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  61.9 
 
 
169 aa  212  2e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  61.9 
 
 
169 aa  212  3e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  60.71 
 
 
170 aa  211  5e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  61.31 
 
 
168 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  1.33405e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  61.18 
 
 
168 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  61.18 
 
 
168 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  4.0176e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  61.18 
 
 
168 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  4.47721e-15 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  59.52 
 
 
169 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  59.76 
 
 
177 aa  205  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  62.34 
 
 
169 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  57.32 
 
 
167 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  58.54 
 
 
167 aa  200  1e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  56.21 
 
 
172 aa  200  1e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  57.74 
 
 
168 aa  199  2e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  57.74 
 
 
168 aa  198  4e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  57.14 
 
 
168 aa  197  1e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  2.67775e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  56.55 
 
 
168 aa  196  2e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  58.18 
 
 
168 aa  195  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  57.14 
 
 
168 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  57.14 
 
 
168 aa  195  4e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  55.62 
 
 
170 aa  190  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  53.89 
 
 
169 aa  187  6e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  52.73 
 
 
178 aa  187  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  54.82 
 
 
173 aa  187  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  54.49 
 
 
167 aa  187  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  55.49 
 
 
170 aa  187  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  52.12 
 
 
171 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  54.32 
 
 
170 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  51.18 
 
 
191 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  55.09 
 
 
167 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  54.32 
 
 
170 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  51.48 
 
 
170 aa  185  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  53.29 
 
 
167 aa  185  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  55.42 
 
 
171 aa  184  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  53.33 
 
 
178 aa  184  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  51.5 
 
 
169 aa  183  1e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  53.89 
 
 
170 aa  184  1e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  53.89 
 
 
170 aa  184  1e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  56.02 
 
 
170 aa  183  1e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  53.42 
 
 
177 aa  183  2e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  52.05 
 
 
184 aa  183  2e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  52.07 
 
 
170 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  52.07 
 
 
170 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  50.88 
 
 
184 aa  179  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  54.12 
 
 
176 aa  179  3e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  55.49 
 
 
178 aa  177  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  52.73 
 
 
169 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  50.88 
 
 
173 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  50.61 
 
 
167 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  52.15 
 
 
170 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  50.59 
 
 
173 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  49.7 
 
 
167 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  52.73 
 
 
171 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  58.52 
 
 
152 aa  175  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  50.91 
 
 
179 aa  174  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  50.3 
 
 
216 aa  173  1e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  50.3 
 
 
167 aa  172  2e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>