More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0030 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
321 aa  652  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  81.47 
 
 
318 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  81.47 
 
 
318 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.57015e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  79.37 
 
 
318 aa  530  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.88499e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  80.37 
 
 
318 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  81.59 
 
 
329 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  80.62 
 
 
320 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  79.37 
 
 
318 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  79.05 
 
 
318 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  79.05 
 
 
318 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  79.87 
 
 
318 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  79.05 
 
 
318 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  79.23 
 
 
324 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  79.13 
 
 
318 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  78.75 
 
 
320 aa  511  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  76.36 
 
 
319 aa  492  1e-138  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  66.77 
 
 
315 aa  448  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  69.03 
 
 
315 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  67.74 
 
 
315 aa  444  1e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  65.06 
 
 
321 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  64.84 
 
 
314 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  65.27 
 
 
315 aa  416  1e-115  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  65.16 
 
 
315 aa  416  1e-115  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  64.84 
 
 
315 aa  416  1e-115  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  65.16 
 
 
315 aa  416  1e-115  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  65.16 
 
 
315 aa  416  1e-115  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  65.16 
 
 
315 aa  416  1e-115  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  65.16 
 
 
315 aa  416  1e-115  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  65.16 
 
 
315 aa  416  1e-115  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  64.63 
 
 
315 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  64.31 
 
 
315 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  64.31 
 
 
315 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  64.31 
 
 
315 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  63.58 
 
 
316 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  64.31 
 
 
315 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  64.31 
 
 
315 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  61.34 
 
 
315 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  63.06 
 
 
312 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  63.02 
 
 
313 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  63.87 
 
 
315 aa  400  1e-110  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  63.87 
 
 
315 aa  400  1e-110  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  61.74 
 
 
314 aa  399  1e-110  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  63.21 
 
 
317 aa  399  1e-110  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  63.87 
 
 
315 aa  400  1e-110  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  61.66 
 
 
315 aa  399  1e-110  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  60.58 
 
 
314 aa  398  1e-110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  63.23 
 
 
315 aa  400  1e-110  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  60.65 
 
 
310 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  6.11556e-15 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  62.26 
 
 
315 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  59.25 
 
 
319 aa  394  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  60.65 
 
 
310 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  60.32 
 
 
310 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  9.86218e-08 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  61.41 
 
 
313 aa  391  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  60.65 
 
 
310 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  4.39837e-07 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  60 
 
 
310 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  59.06 
 
 
327 aa  381  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  60.7 
 
 
314 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  60.65 
 
 
314 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  57.56 
 
 
322 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  55.96 
 
 
312 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  53.55 
 
 
314 aa  357  2e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  53.55 
 
 
314 aa  357  2e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  57.96 
 
 
325 aa  353  3e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  55.15 
 
 
318 aa  349  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  52.9 
 
 
311 aa  346  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  54.17 
 
 
332 aa  342  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0415  methionyl-tRNA formyltransferase  52.58 
 
 
311 aa  336  2e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.467918  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  50.16 
 
 
314 aa  327  2e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  50.16 
 
 
314 aa  326  4e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  55.22 
 
 
307 aa  322  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  52.16 
 
 
308 aa  322  7e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  55 
 
 
325 aa  320  1e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  51.92 
 
 
323 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  52.08 
 
 
308 aa  313  2e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  53.2 
 
 
311 aa  307  1e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  52.15 
 
 
307 aa  304  1e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  51.31 
 
 
307 aa  299  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  50.46 
 
 
327 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  50.15 
 
 
327 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  53.35 
 
 
309 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  49.85 
 
 
327 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  51.46 
 
 
327 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  51.95 
 
 
328 aa  286  3e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  47.52 
 
 
307 aa  286  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  46.82 
 
 
315 aa  285  6e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  47.35 
 
 
348 aa  284  2e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  51.62 
 
 
328 aa  283  3e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  45.4 
 
 
363 aa  282  4e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0926432 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  47.19 
 
 
307 aa  282  6e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  46.36 
 
 
309 aa  281  9e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  51.32 
 
 
331 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 
327 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  46.36 
 
 
309 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  51.31 
 
 
328 aa  279  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  51.63 
 
 
327 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  51.63 
 
 
327 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  50.81 
 
 
330 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  50.81 
 
 
330 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  49.83 
 
 
320 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  49.54 
 
 
323 aa  278  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>