259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0021 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  67.63 
 
 
483 aa  666  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  84.54 
 
 
485 aa  803  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  3.66479e-08 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  65.57 
 
 
483 aa  634  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  81.86 
 
 
485 aa  807  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  89.07 
 
 
485 aa  855  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  84.74 
 
 
485 aa  803  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  84.12 
 
 
485 aa  801  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99675e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
485 aa  971  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  84.54 
 
 
485 aa  803  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.91681e-06  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  89.07 
 
 
485 aa  847  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  81.86 
 
 
485 aa  807  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  68.45 
 
 
485 aa  636  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  65.57 
 
 
483 aa  679  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  69.69 
 
 
485 aa  635  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  82.1 
 
 
486 aa  778  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  84.12 
 
 
485 aa  801  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  87.22 
 
 
485 aa  850  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  90.52 
 
 
485 aa  872  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  84.12 
 
 
485 aa  801  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  83.71 
 
 
485 aa  800  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  68.66 
 
 
485 aa  640  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.77354e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  64.29 
 
 
488 aa  640  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  84.12 
 
 
485 aa  801  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  68.25 
 
 
485 aa  634  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  64.12 
 
 
483 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  64.12 
 
 
483 aa  618  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  64.33 
 
 
483 aa  618  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  63.92 
 
 
483 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  64.74 
 
 
483 aa  613  1e-174  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  64.74 
 
 
483 aa  613  1e-174  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  64.74 
 
 
483 aa  613  1e-174  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.96268e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  64.74 
 
 
483 aa  613  1e-174  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  64.74 
 
 
483 aa  613  1e-174  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  64.54 
 
 
483 aa  613  1e-174  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  65.77 
 
 
483 aa  614  1e-174  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  63.92 
 
 
483 aa  608  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.58715e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  63.92 
 
 
483 aa  608  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.16067e-05  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  63.92 
 
 
483 aa  608  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.19761e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  63.92 
 
 
483 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.85721e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  63.92 
 
 
483 aa  608  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  3.37879e-06 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  63.92 
 
 
483 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  63.92 
 
 
483 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  63.92 
 
 
483 aa  608  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.1848e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  63.92 
 
 
483 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.58223e-06  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  64.33 
 
 
483 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.78342e-06  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  64.33 
 
 
483 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.59691e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  64.12 
 
 
483 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.8042e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  57.11 
 
 
482 aa  578  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  57.73 
 
 
483 aa  555  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  57.11 
 
 
483 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  56.7 
 
 
483 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  55.58 
 
 
483 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  55.26 
 
 
482 aa  522  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  53.81 
 
 
482 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.33585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  52.99 
 
 
481 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  54.81 
 
 
484 aa  506  1e-142  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  49.49 
 
 
487 aa  473  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  49.26 
 
 
483 aa  461  1e-128  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  47.16 
 
 
488 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  45.96 
 
 
485 aa  416  1e-115  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  46.2 
 
 
491 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  42.39 
 
 
486 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  43.89 
 
 
485 aa  408  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  41.44 
 
 
486 aa  408  1e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.93317e-06  unclonable  5.82873e-08 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  43.71 
 
 
488 aa  405  1e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  41.94 
 
 
485 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  42.35 
 
 
474 aa  399  1e-110  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  44.47 
 
 
484 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  42.68 
 
 
485 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  41.36 
 
 
488 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  41.15 
 
 
488 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  42.74 
 
 
481 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  39.79 
 
 
498 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  42.77 
 
 
485 aa  363  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78231e-06 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  43.65 
 
 
481 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  40.12 
 
 
479 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  41.6 
 
 
482 aa  345  8e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  41.6 
 
 
482 aa  343  6e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  40.09 
 
 
482 aa  336  7e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  43.27 
 
 
494 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  38.19 
 
 
479 aa  330  4e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  40.97 
 
 
483 aa  321  2e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  40 
 
 
476 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  36.48 
 
 
478 aa  319  6e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  39.35 
 
 
491 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  38.98 
 
 
466 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  39.52 
 
 
498 aa  314  2e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  40.17 
 
 
477 aa  313  3e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  40.05 
 
 
480 aa  313  4e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  39.2 
 
 
483 aa  304  2e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  34.08 
 
 
485 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  37.47 
 
 
484 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.85199e-10 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  36.05 
 
 
481 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  37.18 
 
 
484 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  35.79 
 
 
485 aa  296  7e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  36.63 
 
 
484 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  36.01 
 
 
483 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  35.07 
 
 
524 aa  295  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  35.85 
 
 
481 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  37.27 
 
 
487 aa  291  1e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>