233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0020 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  416  1e-115  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  70.94 
 
 
204 aa  322  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  71.92 
 
 
211 aa  321  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  71.29 
 
 
204 aa  313  9e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  66.01 
 
 
204 aa  290  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  64.53 
 
 
204 aa  282  2e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  64.04 
 
 
204 aa  281  4e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  64.53 
 
 
204 aa  281  6e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  2.52745e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  65.52 
 
 
204 aa  280  8e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69816e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  63.37 
 
 
204 aa  279  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  65.02 
 
 
204 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  63.55 
 
 
204 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  60.1 
 
 
204 aa  264  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  68.18 
 
 
176 aa  260  7e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  58.5 
 
 
208 aa  254  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  56.86 
 
 
206 aa  247  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  45.18 
 
 
204 aa  182  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19511e-05  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  45.23 
 
 
203 aa  177  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  45.23 
 
 
203 aa  177  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.725e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  45.23 
 
 
203 aa  177  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  43.65 
 
 
204 aa  172  4e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  46.7 
 
 
204 aa  171  6e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  46.7 
 
 
204 aa  171  6e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  46.7 
 
 
204 aa  171  6e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  46.23 
 
 
205 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  46.23 
 
 
205 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  8.31038e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  46.23 
 
 
205 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.8448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  46.23 
 
 
205 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  46.23 
 
 
205 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.21216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  45.6 
 
 
205 aa  166  3e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  44.16 
 
 
204 aa  164  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  45.18 
 
 
204 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  45.18 
 
 
204 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  45.18 
 
 
204 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  42.5 
 
 
204 aa  164  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  40.82 
 
 
204 aa  164  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  41.84 
 
 
203 aa  162  2e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  45.18 
 
 
204 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  40.82 
 
 
204 aa  162  4e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  45.18 
 
 
204 aa  161  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  39.7 
 
 
207 aa  157  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  40.72 
 
 
205 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  45.88 
 
 
207 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  43.08 
 
 
202 aa  153  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  44.12 
 
 
207 aa  151  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  39.8 
 
 
203 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  45.51 
 
 
209 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  41.21 
 
 
208 aa  138  4e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  38.64 
 
 
198 aa  135  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  44.96 
 
 
219 aa  134  1e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  38.83 
 
 
206 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  34.65 
 
 
242 aa  128  7e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  41.67 
 
 
210 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  36.14 
 
 
209 aa  124  8e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  31.72 
 
 
201 aa  124  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  32.66 
 
 
211 aa  121  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.86376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  32.07 
 
 
201 aa  120  2e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  38.26 
 
 
274 aa  117  1e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.87 
 
 
198 aa  117  1e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.27558e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  33.14 
 
 
198 aa  114  1e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  1.64661e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  32.32 
 
 
207 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.70968e-07  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  35.45 
 
 
209 aa  111  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  46.55 
 
 
225 aa  110  1e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  33.16 
 
 
195 aa  110  1e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  32.97 
 
 
194 aa  107  9e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  30.98 
 
 
194 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  49.04 
 
 
190 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  43.06 
 
 
214 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  32.18 
 
 
208 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  34.38 
 
 
195 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  45.6 
 
 
208 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0695  hypothetical protein  36.6 
 
 
207 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  31.61 
 
 
210 aa  104  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  33.93 
 
 
213 aa  104  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  35.42 
 
 
195 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  35.42 
 
 
195 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  35.42 
 
 
195 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  42.75 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  38.15 
 
 
211 aa  102  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  43.75 
 
 
210 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  38.12 
 
 
232 aa  102  4e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  33.51 
 
 
195 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  41.6 
 
 
194 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  41.6 
 
 
239 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  33.51 
 
 
195 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  33.16 
 
 
221 aa  101  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.75512e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 
212 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  5.82787e-07  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  39.23 
 
 
245 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2485  protein of unknown function UPF0029  38.28 
 
 
204 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  34.04 
 
 
194 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  42.74 
 
 
197 aa  99.4  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  31.25 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  33.52 
 
 
212 aa  99  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  42.98 
 
 
222 aa  99  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1712  protein of unknown function UPF0029  36.26 
 
 
196 aa  98.6  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.48018e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  46.43 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>