More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0017 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.55 
 
 
387 aa  644  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.67 
 
 
387 aa  725  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.86 
 
 
387 aa  711  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.16 
 
 
387 aa  722  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  9.28533e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.86 
 
 
387 aa  711  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 
387 aa  790  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.67 
 
 
387 aa  725  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  2.93236e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.28 
 
 
387 aa  750  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.86 
 
 
387 aa  711  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.05749e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  89.9 
 
 
387 aa  721  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.34 
 
 
387 aa  712  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.6 
 
 
387 aa  709  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.02 
 
 
387 aa  747  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.6 
 
 
387 aa  711  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.86 
 
 
387 aa  711  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.16 
 
 
387 aa  719  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.86 
 
 
387 aa  711  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.02 
 
 
391 aa  631  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.07 
 
 
387 aa  625  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.41 
 
 
374 aa  609  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.09 
 
 
387 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0202  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.58 
 
 
386 aa  603  1e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0146484  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.02 
 
 
387 aa  599  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.83 
 
 
387 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.83 
 
 
387 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.83 
 
 
387 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.83 
 
 
387 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.5 
 
 
387 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.06 
 
 
387 aa  591  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.32 
 
 
387 aa  592  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.58 
 
 
387 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  72.54 
 
 
387 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  72.54 
 
 
387 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.8 
 
 
387 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.06 
 
 
387 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.8 
 
 
387 aa  589  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.8 
 
 
387 aa  589  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.54 
 
 
387 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.32 
 
 
386 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.73 
 
 
387 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  72.28 
 
 
387 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.5 
 
 
387 aa  581  1e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.5 
 
 
387 aa  581  1e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.5 
 
 
387 aa  581  1e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.47 
 
 
387 aa  574  1e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.95 
 
 
387 aa  564  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.66 
 
 
391 aa  557  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.93 
 
 
391 aa  552  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.65 
 
 
390 aa  546  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.57 
 
 
390 aa  539  1e-152  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.09 
 
 
390 aa  540  1e-152  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.97 
 
 
391 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.19 
 
 
391 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.45 
 
 
391 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.71 
 
 
391 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.71 
 
 
391 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.71 
 
 
391 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.97 
 
 
391 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.42 
 
 
391 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.42 
 
 
391 aa  516  1e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.42 
 
 
391 aa  516  1e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.23 
 
 
391 aa  504  1e-142  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2392  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.16 
 
 
392 aa  508  1e-142  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.64 
 
 
391 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  48.4 
 
 
401 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  48.64 
 
 
403 aa  348  9e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 
398 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.91 
 
 
398 aa  346  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 
390 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  47.84 
 
 
390 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  46.06 
 
 
399 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.89 
 
 
402 aa  342  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.41 
 
 
401 aa  339  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.41 
 
 
401 aa  339  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.41 
 
 
401 aa  339  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.41 
 
 
401 aa  339  6e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  46.65 
 
 
400 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  46.63 
 
 
396 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
377 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  46.58 
 
 
391 aa  332  8e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.42 
 
 
412 aa  330  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  46.45 
 
 
394 aa  328  8e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.06 
 
 
400 aa  328  1e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
378 aa  327  2e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.16 
 
 
402 aa  326  4e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 
378 aa  325  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  47.93 
 
 
378 aa  325  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.81 
 
 
404 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  46.88 
 
 
402 aa  323  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.31 
 
 
391 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 
392 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.39 
 
 
404 aa  321  1e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.89 
 
 
401 aa  322  1e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  47.12 
 
 
391 aa  321  2e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.65 
 
 
402 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.55 
 
 
401 aa  319  6e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  46.19 
 
 
385 aa  318  8e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  47.12 
 
 
398 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.8 
 
 
402 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  44.8 
 
 
398 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>