129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0016 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1494  transposase  100 
 
 
132 aa  271  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1105  transposase  100 
 
 
132 aa  271  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  2.99322e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1915  transposase  100 
 
 
132 aa  271  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.794502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1615  transposase  100 
 
 
132 aa  271  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2424  transposase  100 
 
 
132 aa  271  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2465  transposase  100 
 
 
132 aa  271  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.364332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0016  transposase  100 
 
 
132 aa  271  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3258  transposase  100 
 
 
132 aa  271  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3706  transposase  100 
 
 
132 aa  271  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0023  transposase  100 
 
 
132 aa  271  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0402  transposase  100 
 
 
132 aa  271  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  92.68 
 
 
411 aa  238  3e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  92.68 
 
 
411 aa  238  3e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  92.68 
 
 
411 aa  238  3e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  92.68 
 
 
411 aa  238  3e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  92.68 
 
 
411 aa  238  3e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  3.53059e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3306  transposase  71.97 
 
 
135 aa  197  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2587  transposase  71.97 
 
 
135 aa  197  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168791  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3491  transposase  71.97 
 
 
135 aa  197  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.503078  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1234  transposase  71.97 
 
 
135 aa  197  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1728  transposase  71.97 
 
 
135 aa  197  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000136689  normal  0.0656378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1370  transposase  71.21 
 
 
135 aa  196  1e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1644  transposase  67.21 
 
 
131 aa  166  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.520277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0340  transposase  67.21 
 
 
131 aa  166  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.487576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1549  transposase  67.21 
 
 
131 aa  166  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.48512e-08  normal  0.103876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0093  transposase  66.39 
 
 
131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2798  transposase  66.39 
 
 
131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.340793  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2067  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0302377  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2000  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.683542  hitchhiker  0.00023796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1556  transposase  66.39 
 
 
131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.19956  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3734  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.475497  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0016  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47262e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0644  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  hitchhiker  0.00011649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3127  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  6.27522e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0435  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.7279e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2046  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0564097  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2297  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000692881  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1757  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926733  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0934  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.18233e-05  normal  0.0829612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2390  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.224522  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1912  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0701676  hitchhiker  6.37024e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3981  transposase  66.39 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2642  transposase  65.57 
 
 
131 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4488  transposase  65.57 
 
 
131 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0166047  normal  0.0142246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2116  transposase  65.57 
 
 
131 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2987  transposase  61.79 
 
 
132 aa  163  6e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1674  transposase  61.79 
 
 
132 aa  163  6e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0282712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0870  transposase  61.79 
 
 
132 aa  163  6e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.432623  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0777  transposase  65.57 
 
 
131 aa  162  1e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3515  transposase  63.93 
 
 
131 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3586  transposase  63.93 
 
 
131 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.865682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3709  transposase  63.93 
 
 
131 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76368  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2778  transposase  63.93 
 
 
131 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3225  transposase  63.93 
 
 
131 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2603  transposase  63.11 
 
 
131 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.01028e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1382  transposase  63.11 
 
 
131 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4289  transposase  63.11 
 
 
131 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3339  transposase  57.38 
 
 
131 aa  151  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.880716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0465  transposase  57.38 
 
 
131 aa  151  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767451  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3563  transposase  57.38 
 
 
131 aa  151  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  62.6 
 
 
409 aa  151  3e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4069  transposase  61.95 
 
 
127 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1623  transposase  61.95 
 
 
127 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1976  transposase  61.95 
 
 
127 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0455365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2331  transposase  61.95 
 
 
127 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2572  transposase  61.95 
 
 
127 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.1064e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3083  transposase  61.95 
 
 
127 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1018  transposase  61.95 
 
 
127 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0189019  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0798  transposase  61.95 
 
 
127 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0682  transposase  61.95 
 
 
127 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0573  transposase  61.95 
 
 
127 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0389976  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0936  transposase orfA  63.16 
 
 
126 aa  148  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506606  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0716  putative transposase orfA  63.72 
 
 
130 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3283  transposase  52.85 
 
 
133 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267707  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3057  transposase  52.85 
 
 
133 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2542  transposase  52.85 
 
 
133 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2539  transposase  52.85 
 
 
133 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2323  transposase  52.85 
 
 
133 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2306  transposase  52.85 
 
 
133 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2171  transposase  52.85 
 
 
133 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.680566 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3617  transposase  52.85 
 
 
133 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.659641  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4442  transposase  53.98 
 
 
135 aa  126  1e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1880  transposase  53.98 
 
 
135 aa  126  1e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2793  transposase  64.44 
 
 
99 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.0738e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1381  transposase  64.44 
 
 
99 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0085723  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2076  IS3 family transposase orfA  52.1 
 
 
132 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.045184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  53.78 
 
 
405 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  53.78 
 
 
405 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  53.78 
 
 
405 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  53.78 
 
 
405 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.99594e-06  hitchhiker  1.66407e-07 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  53.78 
 
 
405 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.71981e-06  decreased coverage  8.62956e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  53.78 
 
 
405 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3302  ISPsy11, transposase OrfA  53.66 
 
 
130 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2127  ISPsy11, transposase OrfA  53.66 
 
 
130 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0498042  hitchhiker  0.00573709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2143  response regulator receiver protein  53.66 
 
 
130 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000143266  hitchhiker  0.000251162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2297  ISPsy11, transposase OrfA  53.66 
 
 
130 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2673  ISPsy11, transposase OrfA  51.75 
 
 
132 aa  113  9e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.451281  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1120  ISPsy11, transposase OrfA  51.75 
 
 
132 aa  113  9e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123327  normal  0.37757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1019  ISPsy11, transposase OrfA  51.75 
 
 
132 aa  113  9e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00833205  normal  0.0895755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2788  ISPsy11, transposase OrfA  51.75 
 
 
132 aa  113  9e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>