276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0013 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0013  ybaK/ebsC protein  100 
 
 
156 aa  309  8e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  65.36 
 
 
155 aa  196  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  8.66016e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  62.18 
 
 
157 aa  184  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2187  hypothetical protein  66.03 
 
 
156 aa  180  8e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0018  ybaK/ebsC protein  63.64 
 
 
155 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  56.86 
 
 
155 aa  177  3e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  53.9 
 
 
155 aa  177  5e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3500  ybaK/ebsC protein  59.48 
 
 
155 aa  173  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00301765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  58.17 
 
 
155 aa  174  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  54.84 
 
 
159 aa  172  2e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  60.65 
 
 
155 aa  171  3e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  53.55 
 
 
159 aa  170  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0092  ybaK/ebsC protein  58.97 
 
 
156 aa  169  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  55.19 
 
 
156 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  52.26 
 
 
159 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  52.26 
 
 
159 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  52.26 
 
 
159 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  52.26 
 
 
159 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  52.26 
 
 
159 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  52.9 
 
 
159 aa  164  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  51.61 
 
 
159 aa  164  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  53.09 
 
 
162 aa  164  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  52.9 
 
 
159 aa  164  6e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  52.9 
 
 
159 aa  164  6e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  50.64 
 
 
156 aa  164  6e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  52.9 
 
 
159 aa  164  6e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  52.9 
 
 
159 aa  164  6e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  52.9 
 
 
159 aa  164  6e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  52.9 
 
 
159 aa  164  6e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  1.16633e-08 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  52.29 
 
 
156 aa  162  1e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  50.64 
 
 
156 aa  162  1e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  54.19 
 
 
159 aa  163  1e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  3.39512e-07 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  52.26 
 
 
159 aa  162  2e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  54.19 
 
 
154 aa  162  2e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  52.26 
 
 
159 aa  161  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  57.52 
 
 
155 aa  161  4e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  51.23 
 
 
162 aa  160  8e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  54.19 
 
 
165 aa  159  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  53.55 
 
 
159 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  53.55 
 
 
159 aa  159  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  52.9 
 
 
159 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30720  ybaK/ebsC protein  56.58 
 
 
158 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685744  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  59.48 
 
 
154 aa  157  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  52.29 
 
 
155 aa  157  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  50.97 
 
 
158 aa  155  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  54.49 
 
 
157 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  51.61 
 
 
158 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  1.71099e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  52.26 
 
 
158 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  52.26 
 
 
158 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  52.26 
 
 
158 aa  154  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  52.26 
 
 
158 aa  154  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  50.97 
 
 
158 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  50.98 
 
 
156 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  49.67 
 
 
156 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  51.28 
 
 
156 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  51.28 
 
 
156 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  49.67 
 
 
156 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  49.67 
 
 
156 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  51.63 
 
 
157 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  50.97 
 
 
158 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  50.32 
 
 
158 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  56.13 
 
 
157 aa  151  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  51.3 
 
 
157 aa  150  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  50.33 
 
 
166 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004197  transcriptional regulator  57.05 
 
 
157 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1029  hypothetical protein  54.19 
 
 
159 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3029  hypothetical protein  55.48 
 
 
159 aa  149  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  51.32 
 
 
166 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0861  ybaK/ebsC protein  59.09 
 
 
154 aa  148  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.935106  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  49.02 
 
 
156 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3346  ybaK/ebsC protein  55.56 
 
 
156 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  50.33 
 
 
170 aa  146  1e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1400  ybaK/ebsC protein  55.26 
 
 
159 aa  146  1e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  52.82 
 
 
168 aa  144  4e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  49.65 
 
 
162 aa  143  8e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1750  hypothetical protein  55.06 
 
 
160 aa  142  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0053342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  51.97 
 
 
160 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  50.98 
 
 
163 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  49.32 
 
 
155 aa  139  1e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  49.36 
 
 
166 aa  137  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3526  ybaK/ebsC protein  49.07 
 
 
166 aa  134  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1664  ybaK/ebsC protein  53.96 
 
 
170 aa  133  1e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773078  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  48.37 
 
 
169 aa  131  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  42.31 
 
 
160 aa  131  4e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  42.76 
 
 
160 aa  130  8e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  50 
 
 
164 aa  129  1e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  46.71 
 
 
164 aa  125  2e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  43.06 
 
 
163 aa  125  2e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  42.47 
 
 
157 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  45.22 
 
 
161 aa  124  4e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4690  ybaK/ebsC protein  49.34 
 
 
193 aa  124  4e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121488  normal  0.0399012 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  44.81 
 
 
169 aa  124  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1777  ybaK/ebsC protein  47.59 
 
 
178 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.875874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4191  ybaK/ebsC protein  48.37 
 
 
186 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0625449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1657  ybaK/ebsC protein  53.55 
 
 
164 aa  119  2e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.66194e-09 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  43.14 
 
 
158 aa  119  2e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  42.48 
 
 
158 aa  119  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  43.14 
 
 
158 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  42.48 
 
 
158 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  43.14 
 
 
158 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>