45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0011 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  296  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  64.58 
 
 
145 aa  196  1e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.03173e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  63.89 
 
 
145 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  63.89 
 
 
145 aa  193  8e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  1.72861e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  64.83 
 
 
150 aa  192  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  60.42 
 
 
146 aa  188  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  63.38 
 
 
145 aa  188  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  64.14 
 
 
146 aa  187  6e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  62.07 
 
 
148 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  61.38 
 
 
148 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  61.38 
 
 
148 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  60.69 
 
 
148 aa  182  1e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49396e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  64.34 
 
 
147 aa  181  4e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  59.72 
 
 
155 aa  174  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  58.87 
 
 
149 aa  162  2e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.70125e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  40.41 
 
 
151 aa  103  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  41.06 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  31.43 
 
 
184 aa  67.8  5e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  29.79 
 
 
167 aa  65.1  3e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  27.59 
 
 
181 aa  64.7  4e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  30.28 
 
 
165 aa  60.8  6e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  30.34 
 
 
167 aa  60.1  1e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  31.25 
 
 
182 aa  56.6  1e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  33.11 
 
 
206 aa  56.2  1e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  31.21 
 
 
144 aa  55.5  3e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  28.08 
 
 
174 aa  54.7  5e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  30.28 
 
 
165 aa  53.9  6e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  28.08 
 
 
177 aa  53.9  7e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  27.21 
 
 
143 aa  52.8  1e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  28.87 
 
 
151 aa  53.1  1e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  31.33 
 
 
178 aa  52.4  2e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  27.4 
 
 
175 aa  50.4  7e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  23.74 
 
 
142 aa  48.5  3e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  23.74 
 
 
142 aa  47.8  6e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1858  MOSC domain-containing protein  33.81 
 
 
145 aa  47  8e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  30.22 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.34 
 
 
310 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  25.98 
 
 
211 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  32.05 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  23.02 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1925  hypothetical protein  27.1 
 
 
226 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  32.05 
 
 
201 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4075  MOSC domain containing protein  32.89 
 
 
205 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  23.65 
 
 
154 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  22.3 
 
 
174 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>