240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0008 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
186 aa  394  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  84.32 
 
 
189 aa  343  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  82.07 
 
 
196 aa  330  7e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.66004e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  79.46 
 
 
198 aa  325  2e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  79.46 
 
 
200 aa  323  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  79.46 
 
 
200 aa  323  8e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.64435e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  79.46 
 
 
200 aa  323  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  78.8 
 
 
191 aa  322  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  78.8 
 
 
191 aa  322  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.68083e-08 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  78.8 
 
 
190 aa  322  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  6.02981e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  78.8 
 
 
191 aa  322  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  78.92 
 
 
204 aa  320  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  78.14 
 
 
189 aa  320  7e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  79.23 
 
 
187 aa  320  9e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  78.49 
 
 
194 aa  311  3e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  74.46 
 
 
187 aa  310  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.76 
 
 
190 aa  266  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.44 
 
 
194 aa  255  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00010  constitutive 3-methyl-adenine DNA glycosylase I  62.09 
 
 
202 aa  243  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.59 
 
 
187 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.43 
 
 
187 aa  234  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.31 
 
 
186 aa  231  4e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.95 
 
 
187 aa  230  8e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.83 
 
 
194 aa  229  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  54.95 
 
 
193 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.61 
 
 
202 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  54.95 
 
 
193 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  54.4 
 
 
193 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  54.4 
 
 
193 aa  227  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  54.4 
 
 
193 aa  227  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.75 
 
 
212 aa  226  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.12 
 
 
214 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.8 
 
 
190 aa  225  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.26 
 
 
190 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.05 
 
 
191 aa  223  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.49 
 
 
188 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.26 
 
 
190 aa  222  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.33 
 
 
187 aa  222  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.33 
 
 
187 aa  221  5e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  53.33 
 
 
187 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  53.33 
 
 
187 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.43 
 
 
217 aa  219  2e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.89 
 
 
193 aa  219  2e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.78 
 
 
187 aa  218  4e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.75 
 
 
212 aa  218  4e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.78 
 
 
187 aa  218  4e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.78 
 
 
187 aa  218  4e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.22 
 
 
187 aa  218  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.75 
 
 
204 aa  218  5e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.44091e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.78 
 
 
187 aa  217  9e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.63 
 
 
191 aa  217  9e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.74 
 
 
192 aa  215  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.8 
 
 
217 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
194 aa  214  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.26 
 
 
208 aa  214  6e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.61 
 
 
196 aa  213  1e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.19 
 
 
190 aa  212  3e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.72 
 
 
198 aa  211  4e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.78 
 
 
198 aa  211  6e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0062  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
183 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  3.18334e-07 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.91 
 
 
208 aa  211  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
218 aa  210  8e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 
186 aa  210  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
183 aa  210  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0348853  normal  0.0800012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.44 
 
 
183 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0674727  hitchhiker  8.56753e-11 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0081  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 
183 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462301  hitchhiker  5.90719e-10 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.46 
 
 
208 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.91 
 
 
208 aa  208  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.67 
 
 
191 aa  208  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  53.3 
 
 
189 aa  207  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.22 
 
 
198 aa  206  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
196 aa  205  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
183 aa  206  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1933  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.89 
 
 
193 aa  205  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
199 aa  203  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
198 aa  204  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  50 
 
 
210 aa  203  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.46 
 
 
191 aa  202  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0013  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.95 
 
 
183 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.1 
 
 
195 aa  202  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.09 
 
 
193 aa  201  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00110  DNA-3-methyladenine glycosidase I  54.35 
 
 
183 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0010  DNA-3-methyladenine glycosidase I  54.35 
 
 
183 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 
188 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.1 
 
 
202 aa  201  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 
188 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
192 aa  200  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.69 
 
 
207 aa  200  1e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
186 aa  200  1e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  50 
 
 
190 aa  199  2e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  50 
 
 
189 aa  199  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0183  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.3 
 
 
183 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.17 
 
 
191 aa  195  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.18 
 
 
195 aa  194  4e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.9 
 
 
223 aa  194  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.17 
 
 
220 aa  194  7e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.3 
 
 
193 aa  193  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.6 
 
 
189 aa  192  3e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0702e-08 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.63 
 
 
185 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.16 
 
 
185 aa  191  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>