92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0025 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0025  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.962727  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0040  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288253  hitchhiker  0.000507453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0043  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0177605  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0047  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00873766  hitchhiker  0.00896999 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07210  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.87743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0039  tRNA-Val  96.08 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00107403  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0014  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14034  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0046  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467185  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0018  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0014  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0015  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  94.12 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07570  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.10137  normal  0.977811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0036  tRNA-Val  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  92.16 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0021  tRNA-Val  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0029  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0245746  normal  0.0651884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0030  tRNA-Val  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000000857099  normal  0.523891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0041  tRNA-Val  90.2 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000505895  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0045  tRNA-Val  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00029215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0001  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna47  tRNA-Val  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0001  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0022  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0121384  normal  0.0431401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0021  tRNA-Val  88.64 
 
 		 69 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16730  tRNA-Val  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251043  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0057  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0071  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0084  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0029  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10750  tRNA-Val  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0033  tRNA-Val  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0028  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465493  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0038  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13840  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0036  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13890  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0287375  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0063  tRNA-Val  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.741524  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0041  tRNA-Val  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0646966 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16760  tRNA-Val  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268589  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0046  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0079  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0056  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0024  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0064  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0032  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.463355  normal  0.0505941 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0031  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0075  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0010  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0048  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.816962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0058  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.547375 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514041  unclonable  8.86692e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0069  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00149713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0031  tRNA-Val  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000451767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0033  tRNA-Val  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000837062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0003  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0223244  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0028  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0051  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0332583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0053  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00198096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0054  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00220789  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1195  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1236  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna41  tRNA-Val  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0030  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0051  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000159293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000423304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>