More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6473 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 492 aa  1016    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  44.69 
 
 		 501 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  44.49 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  40.6 
 
 		 482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  40.42 
 
 		 480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  40.32 
 
 		 485 aa  316  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  38 
 
 		 489 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 		 493 aa  306  6e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.51 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.38 
 
 		 480 aa  299  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.97 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.55 
 
 		 491 aa  296  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.4 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.4 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  36.4 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 		 483 aa  292  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.14 
 
 		 491 aa  286  7e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  38.4 
 
 		 489 aa  286  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.07 
 
 		 481 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.46 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 		 483 aa  275  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  37.01 
 
 		 495 aa  274  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 		 484 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  37.35 
 
 		 504 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  35.19 
 
 		 485 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  36.44 
 
 		 482 aa  269  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  37.34 
 
 		 491 aa  269  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.55 
 
 		 490 aa  266  5e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  36.23 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 		 489 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.19 
 
 		 488 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 		 487 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.21 
 
 		 504 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.87 
 
 		 486 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  35.5 
 
 		 488 aa  239  5.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.99 
 
 		 486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  33.14 
 
 		 488 aa  230  4e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.08 
 
 		 481 aa  219  8.999999999999998e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 		 490 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  31.78 
 
 		 489 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.66 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  32.78 
 
 		 972 aa  196  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.54 
 
 		 472 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.53 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.06 
 
 		 458 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 		 924 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  32.55 
 
 		 933 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  30.2 
 
 		 471 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 		 573 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  29.12 
 
 		 921 aa  172  9e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.91 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.91 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  31.89 
 
 		 577 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  32.78 
 
 		 493 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 		 578 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.13 
 
 		 547 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 		 610 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.15 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  29.73 
 
 		 579 aa  156  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 570 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 		 954 aa  151  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  29.75 
 
 		 557 aa  143  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  28.7 
 
 		 584 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 		 535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  28.25 
 
 		 640 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  28.73 
 
 		 574 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.44 
 
 		 651 aa  136  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  29.3 
 
 		 646 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 		 557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.61 
 
 		 643 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2321  penicillin-binding protein transpeptidase  30.46 
 
 		 642 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011268  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  27.43 
 
 		 648 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  28.79 
 
 		 634 aa  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.02 
 
 		 618 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4064  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.27 
 
 		 765 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2826  penicillin-binding protein 3  30.4 
 
 		 655 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2084  penicillin-binding protein 3  30.11 
 
 		 661 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00596278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2022  penicillin-binding protein 3  30.11 
 
 		 661 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00891602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2238  penicillin-binding protein 3  30.11 
 
 		 661 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000023716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  27.16 
 
 		 678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2265  penicillin-binding protein 3  30.11 
 
 		 661 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4105599999999994e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2221  penicillin-binding protein 3  30.34 
 
 		 661 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00242094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2533  penicillin-binding protein  29.22 
 
 		 655 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0143777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2498  penicillin-binding protein 3  29.96 
 
 		 655 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  26.34 
 
 		 645 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  28.08 
 
 		 600 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2268  penicillin-binding protein  29.43 
 
 		 661 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000872752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  30.23 
 
 		 701 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2350  penicillin-binding protein 3  28.97 
 
 		 661 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  28.69 
 
 		 711 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2022  penicillin-binding protein 3  28.97 
 
 		 661 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000411725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  27.54 
 
 		 646 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  29.52 
 
 		 734 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  27.88 
 
 		 646 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3103  penicillin-binding protein 3  29.89 
 
 		 661 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0111919  hitchhiker  0.000000000000561272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  28.23 
 
 		 629 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>