More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6427 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 414 aa  846    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  69.25 
 
 		 437 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  68.43 
 
 		 437 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  61.22 
 
 		 441 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  61.22 
 
 		 441 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  58.75 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  61.76 
 
 		 454 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  59.31 
 
 		 446 aa  491  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  57.35 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  57.07 
 
 		 440 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  57.89 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  58.09 
 
 		 438 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  57.14 
 
 		 611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  57.42 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  54.96 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  56.86 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  55.93 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  54.94 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  55.05 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  52.16 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  44.55 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  44.61 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  45.26 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  39.95 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 463 aa  326  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  40.68 
 
 		 416 aa  325  8.000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  40.99 
 
 		 404 aa  312  4.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 400 aa  299  7e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 395 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 383 aa  296  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  37.5 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  38.54 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  45.98 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 403 aa  280  4e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.63 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.63 
 
 		 396 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  41.19 
 
 		 377 aa  272  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  37.81 
 
 		 404 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.41 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 413 aa  268  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 		 411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  38.56 
 
 		 420 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  40.65 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  38.05 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 397 aa  262  8e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 395 aa  262  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  36.98 
 
 		 401 aa  259  7e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  37.95 
 
 		 417 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 411 aa  256  5e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.25 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  38.36 
 
 		 407 aa  256  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  38.62 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  34.61 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  34.87 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  40 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  34.62 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  34.62 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 393 aa  249  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  34.44 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  35.97 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  34.53 
 
 		 397 aa  247  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  33.93 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  35.14 
 
 		 393 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  39.84 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  35.31 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  35.49 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  35.13 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>