More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6353 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  50.24 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  46.33 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  49.42 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  44.02 
 
 		 215 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  44.98 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  39.42 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  40.19 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  42.93 
 
 		 219 aa  138  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  40.3 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  38.38 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 216 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  40.69 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  38.38 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  34.54 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6280  transcriptional regulator GntR family  32.83 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  32.12 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3638  hypothetical protein  31.05 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  31.7 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3339  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4065  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  27.23 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  27.36 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3930  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709239  normal  0.547681 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  25.67 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5540  transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  26.24 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3833  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.644681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>