More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6339 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5353  putative transcriptional regulator, TetR family  52.97 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  45.74 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  31.68 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  33.16 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  29.82 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  27.56 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  33.33 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  33.33 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  33.33 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  35.26 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  47.83 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  28.48 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  26.15 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  39.33 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 252 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  29.91 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  49.06 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  24.3 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  39.24 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>