76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6193 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
502 aa  1034  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.05 
 
 
517 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  39.84 
 
 
607 aa  236  9e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.11 
 
 
628 aa  220  4e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  37.33 
 
 
634 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  37.33 
 
 
634 aa  216  6e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  3.21687e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  38.87 
 
 
627 aa  214  4e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.34172e-05  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  37.6 
 
 
634 aa  213  5e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.18487e-06  hitchhiker  3.98389e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.44 
 
 
466 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.68 
 
 
353 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.2 
 
 
340 aa  181  3e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.29 
 
 
376 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.31 
 
 
350 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  32.97 
 
 
355 aa  170  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  35.37 
 
 
329 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.44 
 
 
355 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.45 
 
 
507 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.4 
 
 
347 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 
580 aa  156  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  33.43 
 
 
349 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.17 
 
 
648 aa  146  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  32.94 
 
 
344 aa  142  1e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  6.31807e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.46 
 
 
316 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.82 
 
 
315 aa  132  1e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.29 
 
 
505 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  28.97 
 
 
340 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  29.81 
 
 
341 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.72 
 
 
316 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.72 
 
 
316 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.72 
 
 
316 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  29.84 
 
 
316 aa  122  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.82 
 
 
378 aa  122  2e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  29.84 
 
 
316 aa  122  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  32.66 
 
 
377 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83532e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.14 
 
 
378 aa  120  4e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.72 
 
 
392 aa  120  5e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.97 
 
 
2073 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.21 
 
 
316 aa  114  4e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.52 
 
 
315 aa  113  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.43 
 
 
362 aa  112  1e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.45228e-11  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.15 
 
 
426 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.54 
 
 
315 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.54 
 
 
369 aa  106  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 
333 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.71617e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.3 
 
 
333 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.3 
 
 
333 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.23 
 
 
314 aa  93.6  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  37.78 
 
 
755 aa  85.1  3e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
491 aa  78.6  2e-13  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.43 
 
 
315 aa  77.8  4e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  35.04 
 
 
723 aa  75.1  2e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 
1278 aa  70.1  8e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  34.11 
 
 
649 aa  69.3  2e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  32.12 
 
 
496 aa  64.7  3e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  28.93 
 
 
750 aa  64.7  3e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  28.62 
 
 
319 aa  64.7  4e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  28.64 
 
 
932 aa  64.3  5e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  27.47 
 
 
313 aa  57.4  6e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  33.67 
 
 
931 aa  56.6  1e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  29.84 
 
 
669 aa  54.7  3e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.71 
 
 
495 aa  54.7  4e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.08 
 
 
482 aa  54.3  5e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  26.09 
 
 
344 aa  53.1  1e-05  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 
644 aa  53.1  1e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 
537 aa  50.4  7e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  25.22 
 
 
330 aa  50.1  9e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.6 
 
 
524 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  23.24 
 
 
713 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 
340 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  24.52 
 
 
324 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  28.07 
 
 
373 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  28.89 
 
 
1011 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
304 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  28.32 
 
 
665 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  32.05 
 
 
1049 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  32.31 
 
 
1405 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>