More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6170 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 422 aa  860    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  70.24 
 
 		 421 aa  598  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  68.5 
 
 		 420 aa  593  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  68.88 
 
 		 418 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  70 
 
 		 421 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  68.59 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  68.9 
 
 		 419 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  67.15 
 
 		 416 aa  564  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  67.14 
 
 		 436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  69.27 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  68.59 
 
 		 417 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  68.82 
 
 		 417 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  68.59 
 
 		 417 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  68.82 
 
 		 419 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  66.35 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  68.02 
 
 		 419 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 422 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  66.9 
 
 		 420 aa  538  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  64 
 
 		 426 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  63.55 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  65.33 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  63.03 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  61.18 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 425 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 423 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  61.12 
 
 		 426 aa  496  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  62.8 
 
 		 420 aa  498  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  60.66 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 428 aa  482  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  55.04 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 411 aa  336  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  312  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  312  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 423 aa  311  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 422 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 423 aa  306  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 422 aa  306  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 426 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3636  seryl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000529029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 421 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 420 aa  302  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 431 aa  302  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 426 aa  299  5e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 424 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 427 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  38 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 422 aa  296  5e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 442 aa  296  5e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 423 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 422 aa  296  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 413 aa  295  7e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 427 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0934  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160638  normal  0.296979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 431 aa  293  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 422 aa  292  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 431 aa  292  8e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>