More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6146 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  100 
 
 
690 aa  1365    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  57.47 
 
 
808 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.83 
 
 
743 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  74.03 
 
 
834 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  51.72 
 
 
690 aa  558  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.49 
 
 
737 aa  551  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.5 
 
 
774 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.92 
 
 
616 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.92 
 
 
616 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.88 
 
 
863 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.19 
 
 
578 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.92 
 
 
618 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  65.37 
 
 
715 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.41 
 
 
643 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.84 
 
 
732 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.83 
 
 
765 aa  541  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  66.75 
 
 
729 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.96 
 
 
637 aa  533  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  65.27 
 
 
727 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0051  DNA polymerase III subunits gamma and tau  68.75 
 
 
692 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.05 
 
 
1078 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0694  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.52 
 
 
1202 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.08 
 
 
812 aa  502  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.6 
 
 
855 aa  505  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.92 
 
 
841 aa  500  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  45.36 
 
 
1159 aa  493  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.45 
 
 
878 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  60.1 
 
 
796 aa  491  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  64.01 
 
 
1122 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04710  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  60.41 
 
 
872 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  62.27 
 
 
926 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  60.96 
 
 
712 aa  477  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  58.91 
 
 
872 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  55.84 
 
 
801 aa  443  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  58.47 
 
 
960 aa  430  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  42.27 
 
 
582 aa  323  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.94 
 
 
589 aa  323  9.000000000000001e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.04 
 
 
582 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  41.98 
 
 
579 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.47 
 
 
579 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.35 
 
 
551 aa  301  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.24 
 
 
567 aa  298  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.34 
 
 
569 aa  293  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.68 
 
 
562 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.48 
 
 
570 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.56 
 
 
735 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.58 
 
 
599 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.45 
 
 
562 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.45 
 
 
562 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.45 
 
 
562 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.41 
 
 
562 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.1 
 
 
579 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.49 
 
 
588 aa  286  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.85 
 
 
562 aa  286  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.38 
 
 
562 aa  286  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.85 
 
 
562 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.84 
 
 
582 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.28 
 
 
518 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.5 
 
 
610 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.86 
 
 
562 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  40.77 
 
 
652 aa  281  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.35 
 
 
663 aa  281  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.98 
 
 
562 aa  280  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.97 
 
 
518 aa  280  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.85 
 
 
427 aa  278  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.46 
 
 
649 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  34.22 
 
 
900 aa  279  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.53 
 
 
561 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.75 
 
 
562 aa  277  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.66 
 
 
632 aa  277  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.13 
 
 
522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.08 
 
 
540 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.58 
 
 
559 aa  275  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.47 
 
 
547 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.55 
 
 
550 aa  272  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.28 
 
 
695 aa  270  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  40.26 
 
 
807 aa  270  7e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.47 
 
 
644 aa  270  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.61 
 
 
613 aa  269  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.82 
 
 
755 aa  269  1e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.1 
 
 
562 aa  269  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.11 
 
 
606 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.58 
 
 
602 aa  267  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.42 
 
 
601 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.18 
 
 
575 aa  267  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  36.68 
 
 
568 aa  266  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.42 
 
 
601 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  30.59 
 
 
559 aa  266  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.14 
 
 
611 aa  266  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.82 
 
 
724 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  37.94 
 
 
396 aa  264  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.18 
 
 
550 aa  264  4e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  41.48 
 
 
650 aa  263  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.9 
 
 
617 aa  263  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.6 
 
 
397 aa  263  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.32 
 
 
547 aa  262  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.32 
 
 
547 aa  262  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  42 
 
 
614 aa  260  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.44 
 
 
612 aa  260  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  39.78 
 
 
396 aa  260  6e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>