More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6100 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
482 aa  937    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  51.69 
 
 
496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  51.48 
 
 
496 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  51.48 
 
 
496 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  51.48 
 
 
496 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  51.48 
 
 
496 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  51.09 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  51.3 
 
 
496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  50.1 
 
 
495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  51.09 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  51.09 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  51.09 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  51.3 
 
 
496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  51.09 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  51.3 
 
 
496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  50.21 
 
 
496 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  53.93 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  53.93 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  54.15 
 
 
510 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  36.95 
 
 
405 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  36.95 
 
 
405 aa  276  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  36.95 
 
 
405 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  37.78 
 
 
426 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  37.78 
 
 
426 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  37.25 
 
 
426 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.13 
 
 
408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  28.13 
 
 
406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  28.13 
 
 
408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.13 
 
 
408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.13 
 
 
408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.13 
 
 
408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  28.89 
 
 
406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  28.67 
 
 
406 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  28.67 
 
 
406 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  28.67 
 
 
406 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  28.67 
 
 
420 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  28.64 
 
 
407 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.91 
 
 
408 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  28.89 
 
 
406 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  28.89 
 
 
406 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  28.44 
 
 
408 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
416 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
406 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  28.61 
 
 
406 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.79 
 
 
432 aa  146  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  26.33 
 
 
432 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  25.99 
 
 
432 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  26.22 
 
 
432 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  25.99 
 
 
433 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  29.5 
 
 
435 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.54 
 
 
433 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
417 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
417 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  29.72 
 
 
407 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
417 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
417 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 
417 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  28.03 
 
 
433 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  26.22 
 
 
433 aa  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  25.75 
 
 
433 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  25.99 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.62 
 
 
412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  31.33 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  27.29 
 
 
427 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  27.29 
 
 
427 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
423 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  32.62 
 
 
410 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  28.78 
 
 
434 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  28.47 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  26.74 
 
 
412 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
411 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  28.9 
 
 
434 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  27.68 
 
 
425 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  28.02 
 
 
432 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  28.38 
 
 
432 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  30.82 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  27.93 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  28.54 
 
 
409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
428 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  28.82 
 
 
432 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  27.76 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  27.79 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  28.54 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  24.56 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  26.81 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  28.48 
 
 
474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  26.87 
 
 
423 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  29.98 
 
 
410 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  27.67 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  27.71 
 
 
409 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  28.73 
 
 
474 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  24.79 
 
 
423 aa  127  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  29.43 
 
 
421 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  27.08 
 
 
425 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
410 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  25.66 
 
 
428 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  26.62 
 
 
411 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  27.08 
 
 
425 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
427 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>