74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6058 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  37.97 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  35.93 
 
 		 231 aa  89  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 244 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  31.73 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  34.94 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.81 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.44 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  21.82 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.34 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  21.94 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  22.37 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  27.23 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  24.52 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  23.44 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  25.52 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  19.85 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  20.6 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.14 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 272 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.82 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 278 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  33.16 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  21.83 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  27.44 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  20.88 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  20.22 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  26.15 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  20.82 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.07 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.11 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  22.29 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  23.42 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  19.71 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>