110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5920 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 198 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  64 
 
 		 212 aa  235  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  66.49 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  63.19 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  60.45 
 
 		 201 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  61.24 
 
 		 212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  54.9 
 
 		 205 aa  204  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  53.09 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  53.54 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  50.97 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  64.61 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  59.89 
 
 		 252 aa  184  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  52.28 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  60.11 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  54.82 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  50.82 
 
 		 202 aa  178  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  62.36 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 181 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 181 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 181 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  44.32 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  53.96 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  29.89 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  33.83 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  49.06 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 121 aa  51.2  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  22.51 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.86 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  27.86 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  24.14 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  21.43 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  21.99 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  26.03 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  27.59 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  23.56 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  24.86 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  24.86 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  24.86 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  24.86 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  21.94 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  24.86 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  48.15 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  21.43 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 372 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  31.91 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  25.98 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 		 271 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 118 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  23.4 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  28.98 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  30.63 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  27.5 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  29.82 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  38.82 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  28.41 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  40.38 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  40.38 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  26.76 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 108 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  30.77 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  30.77 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  30.68 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  31.52 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 103 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 103 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  31.91 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  29.67 
 
 		 107 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  20.41 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 114 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  20.41 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 215 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 112 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 114 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 203 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  32.14 
 
 		 114 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 122 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 121 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>