More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5918 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5918  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
927 aa  1908    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2691  glycosyl transferase family 51  35.91 
 
 
711 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0728241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 
975 aa  359  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
979 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
806 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
806 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
806 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.38 
 
 
814 aa  286  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 
725 aa  282  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  31.4 
 
 
821 aa  280  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  29.67 
 
 
838 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
815 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
830 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
950 aa  251  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 
769 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
1245 aa  240  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  29.15 
 
 
719 aa  226  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.53 
 
 
859 aa  224  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  28.85 
 
 
836 aa  224  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  29.05 
 
 
727 aa  216  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
695 aa  209  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  27.41 
 
 
1306 aa  207  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  28.4 
 
 
774 aa  207  7e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
778 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.02 
 
 
764 aa  205  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  27.12 
 
 
978 aa  204  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.41 
 
 
747 aa  204  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  27.55 
 
 
724 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  27.04 
 
 
755 aa  200  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  28.02 
 
 
1117 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.3 
 
 
1129 aa  198  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  27.18 
 
 
751 aa  198  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.55 
 
 
890 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  29.28 
 
 
822 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
1065 aa  197  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  30.43 
 
 
764 aa  197  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  27.89 
 
 
776 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  26.79 
 
 
803 aa  194  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  27.72 
 
 
761 aa  194  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  27.2 
 
 
681 aa  191  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  28.9 
 
 
683 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  27.01 
 
 
905 aa  188  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  27.68 
 
 
811 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  29.63 
 
 
658 aa  188  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  27.65 
 
 
642 aa  187  7e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  28.23 
 
 
680 aa  186  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  27.43 
 
 
765 aa  185  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  26.97 
 
 
867 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  27 
 
 
808 aa  182  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  27.73 
 
 
961 aa  181  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  27.46 
 
 
643 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  27.46 
 
 
643 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  27.99 
 
 
626 aa  181  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  28.34 
 
 
750 aa  181  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
819 aa  179  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  28.62 
 
 
825 aa  178  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  26.36 
 
 
642 aa  178  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  27.06 
 
 
712 aa  178  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  27.35 
 
 
648 aa  177  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  28.46 
 
 
892 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  27.64 
 
 
710 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  26.43 
 
 
661 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  26.95 
 
 
723 aa  174  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  26.31 
 
 
801 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  27.81 
 
 
722 aa  174  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  27.57 
 
 
795 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.19 
 
 
720 aa  173  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  28.09 
 
 
680 aa  172  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  33.4 
 
 
699 aa  172  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  27.63 
 
 
643 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  25.99 
 
 
817 aa  171  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  25.73 
 
 
640 aa  171  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  25.32 
 
 
806 aa  171  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  27.06 
 
 
752 aa  171  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  26.68 
 
 
645 aa  171  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  28.01 
 
 
761 aa  170  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  27.32 
 
 
704 aa  170  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  27.23 
 
 
683 aa  169  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  27.11 
 
 
683 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  27.11 
 
 
683 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  27.83 
 
 
830 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  27.79 
 
 
680 aa  168  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  28.59 
 
 
837 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  25.88 
 
 
640 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  26.31 
 
 
618 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  25.96 
 
 
727 aa  167  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  25.65 
 
 
649 aa  167  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  27.29 
 
 
824 aa  167  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  27.29 
 
 
824 aa  167  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  23.2 
 
 
708 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  26.24 
 
 
644 aa  167  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  27.2 
 
 
683 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  28.32 
 
 
692 aa  166  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  25.66 
 
 
880 aa  166  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  26.9 
 
 
673 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  26.9 
 
 
673 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  25.86 
 
 
772 aa  165  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  27.78 
 
 
651 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  27.68 
 
 
832 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  26.73 
 
 
654 aa  165  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>