More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5880 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  100 
 
 		 315 aa  634    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  37 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  35.45 
 
 		 337 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  32.82 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  31.63 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  33.23 
 
 		 327 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  32.84 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.49 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  31.66 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  34.14 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.84 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  30 
 
 		 350 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  32.91 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  40 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  34.73 
 
 		 301 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  32.52 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  34.38 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  35.74 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  26.08 
 
 		 372 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  26.08 
 
 		 372 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  27.76 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.63 
 
 		 332 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  25.81 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  28.94 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  31.23 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  56 
 
 		 459 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  53.61 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  28.72 
 
 		 350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  31 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  29.43 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  50 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 378 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  27.21 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  28.25 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  50.98 
 
 		 235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  29.18 
 
 		 340 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 453 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  37.58 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  53.76 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  48.42 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 501 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  48.57 
 
 		 446 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  29.69 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  26.48 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 370 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  25.71 
 
 		 363 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 517 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  48.08 
 
 		 162 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  43.52 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  28.91 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 348 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  44.04 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.43 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.96 
 
 		 531 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 374 aa  96.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  48.54 
 
 		 160 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 432 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  41.51 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  45.87 
 
 		 281 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 236 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  56.96 
 
 		 380 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 232 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  41.38 
 
 		 432 aa  92.4  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  40.52 
 
 		 432 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 452 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  47.96 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.66 
 
 		 176 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  38.76 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  43.85 
 
 		 437 aa  90.1  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40 
 
 		 491 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.58 
 
 		 438 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.28 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 625 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 374 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 392 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.93 
 
 		 475 aa  85.9  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.95 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 502 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.27 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.67 
 
 		 210 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  42.06 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  42.99 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.29 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  41.44 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>