More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5872 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5872  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  5.65064e-05  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  54.18 
 
 
252 aa  272  4e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  59.76 
 
 
295 aa  270  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  57.14 
 
 
253 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  52.99 
 
 
248 aa  264  9e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  53.39 
 
 
259 aa  262  5e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  54.88 
 
 
253 aa  262  5e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  56.28 
 
 
255 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.4631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  56.45 
 
 
259 aa  258  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  53.52 
 
 
254 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  53.47 
 
 
249 aa  254  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  54.77 
 
 
248 aa  252  4e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  52.82 
 
 
250 aa  252  5e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  51.61 
 
 
250 aa  251  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  51.97 
 
 
250 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  51.89 
 
 
264 aa  250  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  58.2 
 
 
253 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  52.8 
 
 
245 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  57.79 
 
 
253 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  57.38 
 
 
253 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  60.08 
 
 
254 aa  245  5e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  52.32 
 
 
242 aa  244  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  49.59 
 
 
253 aa  244  1e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  52.59 
 
 
257 aa  244  1e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.07273e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  54.47 
 
 
248 aa  244  1e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  54.44 
 
 
253 aa  243  2e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  51.05 
 
 
249 aa  243  2e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  54.51 
 
 
256 aa  242  4e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  48.82 
 
 
528 aa  242  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  54.33 
 
 
265 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  51.38 
 
 
251 aa  241  8e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  7.10089e-05 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  54.03 
 
 
244 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
510 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  49.21 
 
 
514 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  50.83 
 
 
250 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  51.95 
 
 
577 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  50.42 
 
 
250 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  54.33 
 
 
256 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  49.61 
 
 
518 aa  239  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  50.42 
 
 
250 aa  239  3e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  50.42 
 
 
250 aa  239  3e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  55.78 
 
 
254 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  51.61 
 
 
250 aa  238  6e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.95379e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  50.2 
 
 
523 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  51.91 
 
 
250 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  50.2 
 
 
518 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  49.8 
 
 
523 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  54.98 
 
 
252 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4147  hypothetical protein  51.67 
 
 
241 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.976198  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  53.04 
 
 
247 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  54.98 
 
 
252 aa  235  5e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  54.17 
 
 
256 aa  235  5e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  52.07 
 
 
241 aa  234  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  50.42 
 
 
249 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  50.85 
 
 
519 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  50.85 
 
 
519 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.85 
 
 
519 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.85 
 
 
519 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.85 
 
 
519 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  51.42 
 
 
255 aa  234  1e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  51.46 
 
 
238 aa  233  2e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  49.02 
 
 
523 aa  233  2e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  49.41 
 
 
523 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0787  integral membrane protein TerC  55.51 
 
 
256 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  48.63 
 
 
522 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  48.93 
 
 
253 aa  232  4e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  54.03 
 
 
249 aa  231  7e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  51.64 
 
 
253 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  48.33 
 
 
239 aa  230  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  51.25 
 
 
254 aa  230  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.58 
 
 
516 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.29507e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  49.58 
 
 
518 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
529 aa  229  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.58 
 
 
518 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  50.59 
 
 
268 aa  229  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  48.24 
 
 
522 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  49.58 
 
 
518 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  49.58 
 
 
518 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.58 
 
 
518 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.58 
 
 
518 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  49.58 
 
 
518 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.58 
 
 
518 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.47451e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  48.43 
 
 
518 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  48.51 
 
 
529 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  48.75 
 
 
249 aa  228  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2157  Integral membrane protein TerC  51.19 
 
 
295 aa  228  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2948  Integral membrane protein TerC  50.62 
 
 
240 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  52.85 
 
 
249 aa  228  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  50 
 
 
249 aa  228  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  48.35 
 
 
251 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  50.65 
 
 
527 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  50.4 
 
 
252 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  50.43 
 
 
241 aa  225  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  51.04 
 
 
250 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  51.24 
 
 
251 aa  225  5e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  53.39 
 
 
241 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  8.73859e-07 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  48.03 
 
 
261 aa  223  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  48.41 
 
 
518 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  48.95 
 
 
530 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  47.92 
 
 
252 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>