20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5864 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  264  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5802  hypothetical protein  63.91 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3701  hypothetical protein  41.54 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  38.17 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  33.58 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  33.08 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2315  hypothetical protein  30.58 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  32.52 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  31.11 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2316  hypothetical protein  27.2 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  31.88 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  31.88 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  31.88 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  28.1 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4660  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  30.65 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4956  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  26.98 
 
 		 162 aa  42  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  28.8 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  25.93 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  29.69 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>