148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5784 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 691 aa  1382    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  49.71 
 
 		 706 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  51.5 
 
 		 705 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  47.49 
 
 		 726 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  49.21 
 
 		 705 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  42.4 
 
 		 799 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  43.81 
 
 		 761 aa  492  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.28 
 
 		 755 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.27 
 
 		 766 aa  346  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  36.11 
 
 		 742 aa  345  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  38.43 
 
 		 754 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  36.64 
 
 		 795 aa  340  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.76 
 
 		 732 aa  339  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.27 
 
 		 767 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  33.62 
 
 		 829 aa  337  5.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  35.65 
 
 		 742 aa  337  5.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  37.37 
 
 		 776 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.76 
 
 		 758 aa  329  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.44 
 
 		 733 aa  326  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.04 
 
 		 741 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  37.5 
 
 		 726 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.45 
 
 		 748 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.57 
 
 		 747 aa  317  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  33.11 
 
 		 758 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  35.02 
 
 		 874 aa  313  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  33.6 
 
 		 759 aa  313  4.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.59 
 
 		 757 aa  312  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.81 
 
 		 786 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.77 
 
 		 832 aa  311  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  35.12 
 
 		 734 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  36.64 
 
 		 724 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  36.64 
 
 		 724 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  35.43 
 
 		 735 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.94 
 
 		 788 aa  303  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  36.5 
 
 		 724 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.72 
 
 		 804 aa  290  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  35.33 
 
 		 771 aa  290  8e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  38.55 
 
 		 750 aa  290  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.88 
 
 		 693 aa  288  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  34.56 
 
 		 759 aa  283  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  34.34 
 
 		 706 aa  277  4e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.3 
 
 		 746 aa  268  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.9 
 
 		 685 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.3 
 
 		 813 aa  265  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  33.38 
 
 		 716 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.3 
 
 		 645 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.64 
 
 		 724 aa  253  8.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.62 
 
 		 715 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  42.16 
 
 		 765 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  32.35 
 
 		 717 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  31.35 
 
 		 742 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  34.01 
 
 		 666 aa  244  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  32.1 
 
 		 692 aa  239  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  29.93 
 
 		 715 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  32.1 
 
 		 679 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.94 
 
 		 659 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  31.92 
 
 		 680 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.61 
 
 		 732 aa  230  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  31.66 
 
 		 719 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.74 
 
 		 672 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  30.96 
 
 		 710 aa  216  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  31.56 
 
 		 695 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  40.52 
 
 		 902 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  32.06 
 
 		 717 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.01 
 
 		 695 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.71 
 
 		 670 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.94 
 
 		 728 aa  207  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  31.79 
 
 		 684 aa  207  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.1 
 
 		 764 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  29.88 
 
 		 727 aa  203  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.82 
 
 		 710 aa  203  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  30.36 
 
 		 792 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  42.91 
 
 		 703 aa  185  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  27.93 
 
 		 1048 aa  156  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.69 
 
 		 861 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  22.83 
 
 		 755 aa  144  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  27.08 
 
 		 702 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  36.32 
 
 		 706 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  36.32 
 
 		 706 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.84 
 
 		 753 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.05 
 
 		 716 aa  115  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  34.54 
 
 		 689 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  34.54 
 
 		 689 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  34.54 
 
 		 689 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  34.54 
 
 		 689 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  34.54 
 
 		 689 aa  111  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  34.02 
 
 		 691 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  34.02 
 
 		 691 aa  111  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  34.02 
 
 		 689 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  34.02 
 
 		 691 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  34.02 
 
 		 689 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  35.32 
 
 		 785 aa  109  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.49 
 
 		 763 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.49 
 
 		 763 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.33 
 
 		 736 aa  105  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.81 
 
 		 698 aa  103  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  28.03 
 
 		 703 aa  103  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.33 
 
 		 776 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.33 
 
 		 777 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  34.31 
 
 		 777 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>